Οι περισσότεροι μεγάλοι οργανισμοί χρησιμοποιούν λογισμικό για τη δημιουργία και τη διαχείριση επιταγών μισθοδοσίας για τους υπαλλήλους τους. Αυτό το λογισμικό υπολογιστή παρέχει πλήρη αυτοματοποίηση όλων των μισθοδοσίας για μια εταιρεία. Το καλύτερο λογισμικό μισθοδοσίας σήμερα παρέχει συνήθως πλήρη αυτοματοποίηση των φόρων μισθοδοσίας, των άμεσων καταθέσεων και των εκταμιεύσεων λογαριασμού αποταμίευσης. Αυτό το λογισμικό είναι ενσωματωμένο με αυτοματοποιημένα συστήματα φύλλου χρόνου για να παρέχει μια πλήρη διαδικασία διαχείρισης μισθοδοσίας των εργαζομένων.
Μια εφαρμογή λογισμικού μισθοδοσίας μειώνει τα οργανωτικά έξοδα αυτοματοποιώντας τη δημιουργία ελέγχων μισθοδοσίας εργαζομένων. Αυτό το σύστημα είναι συνήθως διαμορφωμένο με μια εφαρμογή διαχείρισης χρονομέτρησης, η οποία παρακολουθεί τις ώρες εργασίας κάθε εργαζόμενου. Το λογισμικό paycheck προετοιμάζει τους μισθούς σε καθορισμένη βάση. Αυτό μπορεί να ρυθμιστεί για εβδομαδιαίους, μηνιαίους ή τριμηνιαίους κύκλους ελέγχου.
Υπάρχουν πολλοί διαδικτυακοί πάροχοι υπηρεσιών μισθοδοσίας που διατίθενται στο Διαδίκτυο. Αυτές οι εταιρείες διαχειρίζονται τη διαδικασία μισθοδοσίας για μια εταιρεία εξ αποστάσεως. Αυτό το μοντέλο υπηρεσίας χρησιμοποιεί αυτοματοποιημένο λογισμικό πληρωμής. Οι περισσότεροι πάροχοι υπηρεσιών μισθοδοσίας χρεώνουν τους καταναλωτές με βάση τον αριθμό των εργαζομένων που χρησιμοποιούν την υπηρεσία. Αυτή η υπηρεσία θεωρείται ως εξωτερική ανάθεση της διαδικασίας μισθοδοσίας για μια επιχείρηση.
Οι περισσότερες μικρές επιχειρήσεις διαχειρίζονται τη δική τους επεξεργασία μισθοδοσίας. Υπάρχουν πολλά πακέτα λογισμικού μισθοδοσίας που μπορούν να εγκατασταθούν σε έναν τοπικό υπολογιστή. Αυτό το λογισμικό ποικίλλει σε τιμή και πολυπλοκότητα. Επιπλέον, υπάρχουν πολλές δωρεάν εκδόσεις λογισμικού μισθοδοσίας διαθέσιμες στο Διαδίκτυο. Αυτά συνήθως λειτουργούν καλά για μικρές startup εταιρείες με περιορισμένους προϋπολογισμούς.
Το λογισμικό Paycheck είναι διαθέσιμο για πολλά λειτουργικά συστήματα. Αυτό περιλαμβάνει Windows, Mac και Linux. Όταν αγοράζει μια εφαρμογή πληρωμής, ο καταναλωτής πρέπει να βεβαιωθεί ότι είναι συμβατή με το λειτουργικό σύστημα και τους υπολογιστές που χρησιμοποιεί. Αυτό διασφαλίζει ότι η εφαρμογή λογισμικού θα πληροί τα πρότυπα μιας εταιρείας και θα εργαστεί στο υλικό της εταιρείας.
Πολλά προγράμματα λογισμικού μισθοδοσίας έχουν σχεδιαστεί για να ενσωματώνονται σε εμπορικά λογιστικά συστήματα. Αυτό παρέχει έναν καλό τρόπο διαχείρισης της λογιστικής, που μπορεί να βοηθήσει με μηνιαία και τριμηνιαία οικονομική αναφορά. Η ύπαρξη ενός ολοκληρωμένου λογιστικού πακέτου απλοποιεί τη διαδικασία οικονομικής διαχείρισης για μια εταιρεία. Ένα πακέτο all inclusive που είναι συνήθως πιο οικονομικό.
Το λογισμικό ως υπηρεσία (SAAS) είναι μια νέα μέθοδος διαχείρισης λογισμικού υπολογιστών στο Διαδίκτυο. Πολλές εμπορικές εταιρείες προσφέρουν συστήματα λογισμικού μισθοδοσίας χρησιμοποιώντας τη μονάδα SAAS. Αυτό είναι συνήθως λιγότερο ακριβό από το περισσότερο λογισμικό επειδή βασίζεται στον αριθμό των εργαζομένων στην εταιρεία και όχι σε ένα σταθερό κόστος λογισμικού. Οι ενότητες SAAS χρησιμοποιούνται επί του παρόντος στις πωλήσεις, τους ανθρώπινους πόρους, τη λογιστική και τη διαχείριση πελατών.