Η βάση κόστους για τα αμοιβαία κεφάλαια αντιπροσωπεύει το ασφάλιστρο που κατέβαλε ο επενδυτής για να αγοράσει τις μετοχές ενός συγκεκριμένου αμοιβαίου κεφαλαίου. Οι επενδυτές μπορούν να υπολογίσουν τη βάση κόστους μιας εξαγοράς από την πώληση αμοιβαίων κεφαλαίων χρησιμοποιώντας μια λογιστική μέθοδο που ονομάζεται μέθοδος πρώτης εισόδου (FIFO). Εναλλακτικά, οι επενδυτές μπορούν να χρησιμοποιήσουν τη συγκεκριμένη μέθοδο προσδιορισμού ή τη μέθοδο μέσου κόστους, αν και οι κανόνες για τον υπολογισμό της βάσης κόστους για σκοπούς φορολογικής αναφοράς διαφέρουν από χώρα σε χώρα.
Πολλές εταιρείες αμοιβαίων κεφαλαίων απαιτούν από τους επενδυτές να πληρώνουν προμήθειες γνωστές ως φορτία κάθε φορά που αγοράζονται ή πωλούνται μετοχές. Οι προμήθειες που καταβάλλονται κατά τη στιγμή της αγοράς αναφέρονται ως προκαταβολικά φορτία και στις περισσότερες χώρες οι επενδυτές μπορούν να προσθέσουν αυτά τα φορτία στη βάση κόστους για τα αμοιβαία κεφάλαια. Όταν ένας επενδυτής πουλά μια μετοχή, ο επενδυτής αφαιρεί το κόστος της μετοχής και το φορτίο από την αξία εξαγοράς και αναφέρει τη διαφορά ως το φορολογητέο κέρδος από τη συναλλαγή. Οι τιμές των μετοχών των αμοιβαίων κεφαλαίων καθορίζονται μετά το κλείσιμο του χρηματιστηρίου για την ημέρα και η τιμή της μετοχής εξαρτάται από τις αξίες κλεισίματος των τίτλων που διακρατούνται εντός του αμοιβαίου κεφαλαίου. Κατά συνέπεια, εάν ένας επενδυτής αγοράσει έναν αριθμό μετοχών σε ένα συγκεκριμένο αμοιβαίο κεφάλαιο σε μία ημέρα, τότε όλες αυτές οι μετοχές θα έχουν την ίδια τιμή και την ίδια βάση κόστους.
Όταν ένας επενδυτής αγοράζει έναν αριθμό μετοχών σε ένα συγκεκριμένο αμοιβαίο κεφάλαιο σε διαφορετικές χρονικές περιόδους, τότε κάθε μία από αυτές τις μετοχές έχει διαφορετική βάση κόστους. Εάν ο επενδυτής στη συνέχεια πουλά αυτές τις μετοχές σε τακτά χρονικά διαστήματα, ο επενδυτής πρέπει κανονικά να υπολογίσει τη βάση κόστους των μετοχών χρησιμοποιώντας τη μέθοδο FIFO. Σύμφωνα με το FIFO, θεωρείται ότι οι πρώτες μετοχές που αγοράζει ένας επενδυτής είναι οι πρώτες μετοχές που ο επενδυτής πουλά.
Η συγκεκριμένη μέθοδος αναγνώρισης δίνει τη δυνατότητα στους επενδυτές να προσδιορίσουν τις μετοχές που εξαγοράζονται σε μια συγκεκριμένη χρονική στιγμή. Αυτό σημαίνει ότι ένας επενδυτής μπορεί να επιλέξει να πουλήσει τις μετοχές που αγοράστηκαν στην υψηλότερη τιμή, ώστε να ελαχιστοποιήσει τα κέρδη κεφαλαίου και τους φόρους που προκύπτουν από την εξαγορά της μετοχής. Η μέθοδος μέσου κόστους περιλαμβάνει την πρόσθεση του συνολικού κόστους των αγορών των μετοχών και των προμηθειών φόρτωσης και τη διαίρεση αυτού του συνόλου μεταξύ του αριθμού των μετοχών που κατέχει ο επενδυτής. Κάθε μετοχή έχει τότε την ίδια βάση κόστους, αν και τα κέρδη κεφαλαίου από την εξαγορά μετοχών μπορεί να διαφέρουν εάν ο επενδυτής πουλήσει τις μετοχές σε διαφορετικές χρονικές στιγμές.
Ορισμένες εταιρείες αμοιβαίων κεφαλαίων πωλούν τα λεγόμενα κεφάλαια χωρίς φορτίο και οι επενδυτές δεν χρειάζεται να πληρώσουν φορτία για να αγοράσουν αυτές τις μετοχές. Σε πολλές περιπτώσεις, ωστόσο, οι μέτοχοι με μετοχές χωρίς φορτίο πρέπει να πληρώσουν προμήθειες συναλλαγής για την αγορά μετοχών, αλλά αυτές είναι προμήθειες επεξεργασίας σε αντίθεση με τις προμήθειες πωλήσεων και δεν θεωρούνται ως μέρος της βάσης κόστους για τα αμοιβαία κεφάλαια. Επομένως, οι προμήθειες συναλλαγής δεν προστίθενται στην τιμή αγοράς κατά τον υπολογισμό της βάσης κόστους για τα αμοιβαία κεφάλαια, εκτός εάν ο επενδυτής μπορεί να διαγράψει αυτές τις προμήθειες ως φορολογικές εκπτώσεις.