Υπάρχουν διάφορα βήματα που μπορούν να γίνουν για να γίνουν φυτοθεραπευτές. Γενικά, ένα άτομο θα παρακολουθούσε μαθήματα με ειδίκευση στη φυτοθεραπεία, τη χρήση φυτών και βοτάνων στην ιατρική. Ορισμένες χώρες προσφέρουν συγκεκριμένα πανεπιστημιακά πτυχία στη φυτοθεραπεία, ενώ άλλες όχι. Ομοίως, ορισμένοι απαιτούν άδεια και εγγραφή προτού ένα άτομο είναι νομικά σε θέση να ασκήσει, ενώ άλλες χώρες δεν το κάνουν.
Υπάρχουν μερικά πανεπιστήμια που παρέχουν στους φοιτητές τους τη δυνατότητα να λάβουν πτυχίο που ειδικεύεται στη φυτοθεραπεία. Αυτό είναι ένα καλό σημείο εκκίνησης για κάποιον που θέλει να γίνει φυτοθεραπευτής. Σε ορισμένα πανεπιστήμια της Νότιας Αφρικής, για παράδειγμα, οι μαθητές μπορούν να ολοκληρώσουν πενταετή πτυχίο στη φυτοθεραπεία. Παρακολουθούν μαθήματα γενικής επιστήμης, όπως χημεία και βιολογία, αλλά παρακολουθούν μαθήματα που εστιάζουν στη μελέτη φαρμακευτικών φυτών, όπως η φαρμακολογία βοτάνων και οι φυσικές αρχές θεραπείας. Συνήθως θα το κάνουν σε πανεπιστημιακό περιβάλλον, συμπληρωμένο με ερευνητικά προγράμματα και κλινικές εργασίες.
Εναλλακτικά, ορισμένες χώρες, όπως η Αυστραλία, εστιάζουν περισσότερο σε προγράμματα εξ αποστάσεως εκπαίδευσης ή αλληλογραφίας που ειδικεύονται στη φυτοθεραπεία για φοιτητές τόσο στο εσωτερικό όσο και στο εξωτερικό. Αυτός είναι ένας καλός τρόπος για να γίνετε φυτοθεραπευτής εάν δεν υπάρχει διαθέσιμη πρακτική εκπαίδευση. Οι μαθητές μαθαίνουν κυρίως μέσω της χρήσης DVD, CD και σχολικών βιβλίων, αλλά ορισμένα προγράμματα περιλαμβάνουν τη δυνατότητα να θέτουν απευθείας ερωτήσεις από έναν εκπαιδευτή Διαδικτύου. Συνήθως, αυτά τα προγράμματα μπορούν να διαρκέσουν από ένα έτος έως αρκετά χρόνια για να ολοκληρωθούν, ανάλογα με το αν ένας φοιτητής είναι πλήρους ή μερικής απασχόλησης.
Στις Ηνωμένες Πολιτείες, υπάρχουν φυτικά ή φυσιοπαθητικά προγράμματα παρόμοια με αυτά που λαμβάνει κάποιος που θέλει να γίνει φυτοθεραπευτής, αλλά είναι συνήθως περισσότερο σαν μακροσκελή εργαστήρια. Ορισμένα εργαστήρια ενδέχεται να χρειαστούν εκατοντάδες ώρες για να ολοκληρωθούν, ενώ άλλα ολοκληρώνονται σε λίγες ημέρες. Πολλά από αυτά τα εργαστήρια καλύπτουν και άλλες μορφές εναλλακτικής ιατρικής, όπως ο βελονισμός και η κινεζική ιατρική. Ανάλογα με τον τόπο κατοικίας, ορισμένοι άνθρωποι που λαμβάνουν πιστοποιητικά ή πτυχία φυσικής ιατρικής μπορεί να χρειαστεί να εγγραφούν στις κυβερνήσεις των κρατών τους, όπως συμβαίνει στην Ουάσινγκτον και την Καλιφόρνια, για παράδειγμα.
Ενώ η φυτοθεραπεία δεν αναγνωρίζεται στις Ηνωμένες Πολιτείες, ορισμένες χώρες απαιτούν την άδεια των φυτοθεραπευτών τους. Για παράδειγμα, κάποιος που θέλει να γίνει φυτοθεραπευτής στη Νότια Αφρική θα πρέπει να εγγραφεί στο Συμμαχικό Επαγγελματικό Συμβούλιο Υγείας προτού μπορέσει να εξασκηθεί. Η διαδικασία εγγραφής απαιτεί από έναν επαγγελματία να συμπληρώσει μια αίτηση και να αποδείξει ότι ολοκλήρωσε το πτυχίο της, συμπεριλαμβανομένων μαθημάτων τριών ετών γενικής ιατρικής επιστήμης και δύο ετών μαθημάτων σε μαθήματα που εστιάζουν ειδικά στη φυτοθεραπεία.