Există o serie de tipuri de ferme de acvacultură care cresc diferite tipuri de pești, crustacee și moluște. Există și ferme de acvacultură care cresc plante acvatice, precum algele marine. În multe cazuri, aceste plante și animale sunt destinate consumului uman, dar există câteva excepții. De exemplu, unele ferme de acvacultură cresc pești care sunt utilizați în acvarii. Aceste tipuri de pești sunt adesea denumite pești ornamentali.
Unele dintre cele mai comune ferme de acvacultură sunt fermele de pește, fermele de stridii și fermele de creveți. Fermele de acest fel pot folosi o serie de metode pentru a-și crește stocul. În unele cazuri, majoritatea operațiunilor au loc în rezervoare și instalații care se află pe uscat. Alții folosesc facilități care se află de-a lungul țărmului. În aceste cazuri, stocul este crescut într-un mediu marin natural care este închis sau cumva reglementat de pescuit.
Fermele care folosesc mediile marine naturale pentru a-și crește stocul în loc să se bazeze în întregime pe operațiuni terestre practică ceea ce se numește maricultura. Practica cade sub umbrela acvaculturii. Produsele care sunt recoltate în aceste tipuri de ferme sunt adesea produse în aceleași scopuri și vândute pe aceleași piețe ca și produsele din fermele terestre.
Atunci când fermele cresc plante acvatice, acestea participă la un proces numit algacultura, care, la fel ca maricultura, intră sub umbrela acvaculturii. Există diverse utilizări pentru produsele care sunt cultivate în fermele de algacultură. Algele care sunt cultivate în aceste tipuri de ferme au atât utilizări comerciale, cât și industriale. Poate fi folosit pentru o varietate de produse, de la alimente la bioplastice.
Fermele acvaponice sunt ferme de acvacultură care integrează cultura de plante și pește sau crustacee. Aceste tipuri de ferme folosesc un sistem ciclic în care plantele și animalele acvatice se bazează pe o relație simbiotică. Deșeurile care sunt produse de un anumit tip de pește, de exemplu, pot fi filtrate din apă de un anumit tip de plantă. Pe lângă filtrarea apei și detoxifierea ei pentru pești, plantele se bazează și pe deșeuri pentru nutrienții săi. Aceste tipuri de ferme de acvacultură sunt adesea foarte eficiente în utilizarea apei.