Scopul managementului habitatului este de a realiza cea mai bună combinație posibilă între locuința umană și natură. Operațiunile de conservare a vieții sălbatice acționează pentru a menține echilibrul prin protejarea plantelor și animalelor pe cale de dispariție de interferențele umane. În schimb, multe programe de gestionare a pădurilor folosesc intervenția umană ca o modalitate de a accelera procesele de creștere care ar dura decenii sau chiar secole să apară în mod natural. Ocazional, umanitatea este amenințată de activitatea animalelor sau a plantelor și, în acele cazuri, organizațiile de management al faunei sălbatice sunt cele care restabilesc echilibrul.
Frecvent, metodele de management al habitatelor sunt folosite pentru a proteja teritoriile speciilor pe cale de dispariție. De exemplu, din cauza înclinației sale pentru incendii de vegetație, tufișurile Fynbos din Africa de Sud găzduiesc o varietate de specii care s-au adaptat în mod special la aceste condiții dure. Un număr dintre aceste specii nu există nicăieri altundeva pe pământ. Pentru a asigura supraviețuirea acestor plante și animale, se acordă mare grijă pentru a evita interacțiunea umană cu această zonă.
În inițiative mai direcționate de conservare a faunei sălbatice, poate fi necesară acțiunea manuală a omului pentru a salva un animal. În aceste cazuri, membrii speciilor pe cale de dispariție pot fi capturați și plasați în medii artificiale în scopuri de protecție și reproducere. Rezultatul scontat al acestui tip de program este de obicei restabilirea unor bazine de reproducere viabile. În multe cazuri, scopul final este reintroducerea unei specii în habitatul său natural.
Managementul habitatului unei suprafețe mari de arbori este adesea numit management forestier. Deși punctul focal al acestui tip de conservare sunt în mod clar copacii, eforturile sunt extinse în mod regulat pentru a include habitatele de plante și animale pe care aceste zone le oferă. În America de Nord, managementul pădurilor studiază în primul rând arboretele de foioase, dar principiile pot fi extinse și pentru a acoperi pădurile tropicale și junglele.
Scopul ecologic standard pentru managementul habitatului forestier este un model de creștere numit pădure înaltă. Toate etapele de creștere a copacilor, de la puieți până la căderi de morți sunt reprezentate în acest ecosistem. În plus, viața animală și vegetală este abundentă și variată. Dacă nu sunt deranjați, biomii pădurii înalți ar apărea în mod natural. Prin practici atente de gestionare a pădurilor, cum ar fi lemnul selectiv, acest tip de biom poate fi conservat și îmbunătățit.
În cazuri rare, scopul managementului habitatului este de a împiedica animalele să pună în pericol populațiile și proprietățile umane. În unele zone, de exemplu, o combinație de reproducere necontrolată, vânătoare limitată și acces la sursele de hrană pentru oameni au condus la o suprapopulare de cerb coada albă. Ca urmare, rapoartele privind daunele materiale și rănile cauzate de accidente de căprioare versus vehicule au crescut dramatic. Au crescut, de asemenea, incidentele daunelor semnificative ale culturilor de la hrănirea căprioarelor. Răspunsurile birourilor locale de management al faunei sălbatice includ programe de relocare a animalelor și sezoane de vânătoare mai lungi.