Plantele cultivate organic sunt cele produse fără utilizarea produselor artificiale; de obicei, îngrășăminte, pesticide și erbicide. În schimb, tot ceea ce se aplică unor astfel de culturi trebuie să apară în mod natural, ceea ce înseamnă adesea că este nevoie de mai multă forță de muncă pentru a produce aceste culturi, dar cultivatorul garantează că nu au fost atinse de substanțele chimice produse de om. Lucerna organică este una dintre aceste culturi și poate fi cultivată ca hrană pentru animale, care este folosită pentru a produce alimente sau transformată în suplimente alimentare pentru oameni.
Atunci când se produc culturi ecologice, buruienile pot deveni o problemă serioasă dacă nu sunt controlate în mod adecvat. O metodă de a minimiza creșterea buruienilor este de a menține câmpul plantat continuu fie cu lucernă organică, fie cu o cultură de acoperire, cum ar fi iarba de ovăz. Această metodă menține suprafața acoperită cu o plantă de dorit, care de obicei vine groasă și crește rapid, sufocând majoritatea buruienilor înainte de a putea începe. Cu puțin timp înainte de a planta lucerna, iarba de ovăz este arătă și lăsată să putrezească, astfel încât să servească și ca îngrășământ, sau ceea ce se numește în mod obișnuit îngrășământ verde, și să ofere nutrienți pentru noua cultură.
Lucerna organică este, de asemenea, fertilizată în mod obișnuit cu gunoi de grajd vechi de la hambare de cai sau vite sau compost organic îmbătrânit care poate include tăieturi de iarbă putrezită și deșeuri de bucătărie, precum și alte materiale vegetale. Este important ca tot ce se adaugă în compost să fie organic, deoarece contaminanții chimici în orice etapă a procesului pot însemna că lucerna rezultată nu mai este cu adevărat organică. Majoritatea cultivatorilor de culturi ecologice sunt meticuloși cu privire la astfel de lucruri și fac eforturi mari pentru a evita orice posibilitate ca materialele neorganice să intre în contact cu culturile lor.
Deoarece pesticidele chimice sunt cu siguranță produse de om, cultivatorii de lucernă organică trebuie să găsească alte modalități de a face față dăunătorilor care sunt atrași de câmpuri. O metodă foarte populară este utilizarea controalelor naturale, în special insectele prădătoare care pradă acele insecte care altfel ar putea distruge cultura organică de lucernă. Buburuzele, anumite viespi, gândacii pirați și mantis rugător sunt toate folosite pentru a controla diferiți dăunători, fără a fi nevoie să recurgă la aplicarea unor substanțe chimice care pot fi periculoase.
În ciuda costului mai mare al lucernei organice, în parte pentru că este mai scump de produs, mulți oameni consideră că merită costul suplimentar pentru a evita problemele de sănătate care însoțesc atât de multe dintre produsele artificiale care sunt de uz comun. Când lucerna este folosită ca hrană pentru animale, nu există nicio șansă ca pesticide nesănătoase sau alte substanțe chimice să se acumuleze în carnea sau laptele animalelor care produc alimente. În unele cazuri, lucerna organică este folosită pentru a face un supliment nutritiv pentru oameni, iar majoritatea persoanelor care aleg să folosească astfel de suplimente par să prefere ca produsul să nu fie făcut din lucernă care a fost expusă la substanțe chimice potențial dăunătoare.