Anticorpii Western blot sunt proteine mari în formă de Y, sau imunoglobuline, produse pentru a fi utilizate în imunotestul Western blot, un test pentru a detecta o proteină asociată într-o cultură de țesut. Multe companii sunt specializate în producerea și furnizarea de anticorpi către laboratoarele care utilizează metoda Western blot. Există două tipuri de anticorpi Western blot care pot fi produși în laborator: monoclonali și biclonali. Metoda și tipul de anticorp produs depind de modul în care anticorpul se reproduce în mod natural în corpul gazdă. În timpul testării Western blot, un proces numit electroforeză pe gel este utilizat pentru a separa proteinele care sunt native din proba de țesut de anticorpii Western blot țintiți, ceea ce duce la o identificare pozitivă.
Aproape orice substanță poate fi utilizată pentru a produce un anticorp monoclonal care se va lega de proteina înrudită într-o cultură Western blot. Anticorpii policlonali sunt produși în mare parte în același mod, dar procesul este mai complicat prin faptul că anticorpii trebuie să fie recoltați din resursele de celule B imune în loc să fie pur și simplu donați dintr-o celulă părinte. Tehnologia în creștere de producere a imunoglobulinei din diverse substanțe este considerată un instrument de neprețuit în biochimie, biologie moleculară și medicină. Analiza Western blot poate detecta proteinele asociate cu HIV, boala Lyme și boala Creutzfeldt-Jakob – boala vacii nebune -, ceea ce duce la faptul că medicii pot pune un diagnostic definitiv mai devreme în cursul progresiei bolii. Pe lângă aceste aplicații, criminalistică poate folosi și tehnologia de anticorpi Western blot pentru a identifica probe de sânge sau alte substanțe la locul crimei.
Indiferent de aplicația sa, procesul de identificare a unei proteine țintite într-o probă de țesut începe cu reproducerea unei cantități de anticorp dintr-o sursă cunoscută. Anticorpii monoclonali pot fi produși din cultura existentă, dar procesul de producere a anticorpilor policlonali necesită mult mai mult timp. Procesul implică de obicei injectarea unui animal gazdă, cum ar fi un șoarece sau o capră, cu particule inactive sau vii, moment în care limfocitele B ale animalului produc imunoglobuline care sunt specifice antigenului. În continuare, la probă se adaugă detergenți și soluții tampon care vor împiedica digestia imunoglobulinelor de către orice enzime native, iar electroforeza pe gel este utilizată pentru a separa proteinele după greutatea moleculară sau sarcina izoelectrică. Anticorpii Western blot sunt acum gata să treacă prin procesul de „blotting”, care este transferul anticorpilor către o membrană, luând în considerare modelele specifice de blot produse în timpul transferului, care sunt unice pentru proteina identificată.