Ένα βακτηριακό φίλτρο είναι μια συσκευή ή ένθετο φιλτραρίσματος που εμποδίζει τη διέλευση οργανισμών άνω του συγκεκριμένου μεγέθους, περιορίζοντας την κίνηση των περισσότερων βακτηρίων. Τέτοια φίλτρα είναι χρήσιμα σε προμήθειες αέρα και άλλες συσκευές που μπορεί να έρθουν σε επαφή με άρρωστους ασθενείς, όπως τα σπιρόμετρα που χρησιμοποιούνται σε αξιολογήσεις της χωρητικότητας των πνευμόνων. Πωλούνται από επιστημονικούς και ιατρικούς προμηθευτές και μερικές φορές είναι διαθέσιμα σε καταστήματα υλικού και παρόμοιες τοποθεσίες.
Η αποτελεσματικότητα ενός βακτηριακού φίλτρου καθορίζεται από το μέγεθος των σωματιδίων που μπορούν να ταξιδέψουν μέσα από αυτό. Η συσκευασία πρέπει να αναφέρει το επίπεδο φιλτραρίσματος που παρέχεται. Μπορεί να παρέχει μια μέτρηση καθώς και μια εκτίμηση του ποσοστού των οργανισμών που το φίλτρο πρέπει να μπλοκάρει με επιτυχία. Οι σχεδιαστές πρέπει να επιτύχουν μια ισορροπία όταν πρόκειται για την ανάπτυξη βακτηριακών φίλτρων. Εάν το φίλτρο δεν είναι αρκετά πορώδες, ο αέρας και άλλα υλικά ενδέχεται να μην κυκλοφορούν, αλλά εάν είναι πολύ πορώδες, τα βακτήρια μπορούν να περάσουν.
Τα συστήματα κλιματισμού και οι παροχές αέρα έχουν συχνά βακτηριακό φίλτρο. Το φίλτρο εμποδίζει τα βακτήρια να περάσουν σε μια καθαρή περιοχή και θα κρατήσει τους ανθρώπους πιο ασφαλείς. Σε επιστημονικά εργαστήρια όπου οι ερευνητές μπορούν να χειριστούν επικίνδυνους οργανισμούς, οι κουκούλες και οι αεραγωγοί πάνω από τους σταθμούς εργασίας χρησιμοποιούν επίσης φιλτράρισμα για να αποτρέψουν τη διαφυγή μικροοργανισμών. Εάν κάποια χαλαρώσει, θα παγιδευτεί στο φίλτρο πριν προλάβουν να φτάσουν στο εξωτερικό.
Σε ιατρικές συσκευές όπως σπιρόμετρα, αναπνευστικές μάσκες και ούτω καθεξής, τα βακτηριακά φίλτρα περιορίζουν την εξάπλωση μικροοργανισμών μεταξύ των ασθενών. Μπορεί να είναι μιας χρήσης ή επαναχρησιμοποιήσιμα, ανάλογα με το σύστημα. Το σύστημα έχει συνήθως μια υποδοχή για ένα φυσίγγιο ή ένα φύλλο και μπορεί να είναι δυνατή η χρήση τυπικών προϊόντων βακτηριακού φίλτρου επιπλέον αυτών που παρέχονται από τον κατασκευαστή. Τα επαναχρησιμοποιήσιμα φίλτρα μπορεί να έχουν μια ενδεικτική λωρίδα για να προειδοποιεί τον χειριστή όταν το βακτηριακό φίλτρο πρόκειται να λήξει ή μπορεί να αντικατασταθεί σύμφωνα με ένα χρονοδιάγραμμα σύμφωνα με τη χρήση.
Τέτοια φίλτρα είναι επίσης χρήσιμα σε αντλίες νερού και άλλα συστήματα φιλτραρίσματος υγρών. Τα βακτήρια και άλλοι μικροοργανισμοί μπορούν να συσσωρευτούν σε δεξαμενές, δεξαμενές αποθήκευσης και παρόμοια περιβάλλοντα. Το φιλτράρισμα μπορεί να αποτρέψει την εξάπλωση μεταξύ των δοχείων και μπορεί επίσης να περιορίσει τη διείσδυση βακτηρίων στα υδραυλικά και δημοτικά αποθέματα νερού. Τα βακτηριακά φίλτρα μπορούν επίσης να είναι πολύ χρήσιμα για δραστηριότητες όπως η παρασκευή μπύρας και κρασιού, όπου είναι απαραίτητο να υπάρχει αερισμός για τη διευκόλυνση της ζύμωσης, αλλά ο ζυθοποιός ή ο οινοποιός δεν θέλει βακτήρια και άλλους επικίνδυνους οργανισμούς να μολύνουν την παρτίδα στη δεξαμενή.