Ένα εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα δεν λειτουργεί όσο καλά θα έπρεπε, επειδή τα συστατικά είναι εξασθενημένα ή λείπουν. Οι ασθενείς μπορεί να αναπτύξουν ανοσοκαταστολή, όπως είναι γνωστό, ως αποτέλεσμα ιατρικών θεραπειών, υποκείμενης νόσου ή συγγενών παθήσεων. Όσο το ανοσοποιητικό σύστημα δεν είναι πλήρως λειτουργικό, ο ασθενής διατρέχει αυξημένο κίνδυνο λοιμώξεων και είναι λιγότερο ικανός να τις καταπολεμήσει. Υπάρχουν διαθέσιμες θεραπείες για την αντιμετώπιση αυτών των ανησυχιών, είτε η ανοσοκαταστολή είναι προσωρινή είτε μόνιμη.
Μερικοί ασθενείς έχουν συγγενείς ανοσοανεπάρκειες, πράγμα που σημαίνει ότι το ανοσοποιητικό τους σύστημα δεν λειτουργεί σωστά επειδή το σώμα τους δεν μπορεί να δημιουργήσει ορισμένα κύτταρα ή να ρυθμίσει τη λειτουργία του ανοσοποιητικού. Σε άλλες περιπτώσεις, ένα εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα είναι μια επίκτητη κατάσταση, που προκαλείται από έκθεση σε τοξίνες, λοιμώξεις όπως ο ιός της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας (HIV) ή ορισμένα φάρμακα. Ορισμένα φάρμακα μπορεί να καταστέλλουν τη λειτουργία του ανοσοποιητικού ως παρενέργεια, όπως παρατηρείται με τα αντικαρκινικά φάρμακα και ορισμένα στεροειδή. Τα οφέλη της θεραπείας υπερτερούν των κινδύνων, αλλά ο ασθενής πρέπει να παρακολουθείται καθ’ όλη τη διάρκεια της θεραπείας.
Ορισμένες ιατρικές θεραπείες μπορεί να απαιτούν τη σκόπιμη πρόκληση ενός εξασθενημένου ανοσοποιητικού συστήματος. Οι ασθενείς που προετοιμάζονται για μεταμοσχεύσεις, για παράδειγμα, πρέπει να καταστέλλουν το ανοσοποιητικό τους σύστημα, ώστε να μην απορρίπτουν το μόσχευμα. Πρέπει επίσης να λαμβάνουν ανοσοκατασταλτικά φάρμακα εφ’ όρου ζωής για να αποτρέψουν την έναρξη της απόρριψης. Μια προσωρινή κατάσταση σοβαρού ανοσοποιητικού συμβιβασμού μπορεί να προκληθεί ακριβώς πριν από μια μεταμόσχευση μυελού των οστών, όπου ο μυελός του δότη θα αντικαταστήσει τελικά την ανοσολογική λειτουργία.
Οι μολυσματικοί οργανισμοί είναι πιο πιθανό να κολλήσουν σε έναν ασθενή με εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα, συμπεριλαμβανομένων σπάνιων οργανισμών που συνήθως δεν προκαλούν ασθένεια σε υγιή άτομα. Το σώμα δεν διαθέτει τις άμυνες για να εντοπίσει και να καταστρέψει βακτήρια, ιούς και άλλες αιτίες ασθενειών. Επιπλέον, μόλις αναπτυχθεί μια μόλυνση, το σώμα είναι λιγότερο ικανό να την καταστείλει. Αυτό σημαίνει ότι ένα «συνηθισμένο» κρυολόγημα ή γρίπη θα μπορούσε να γίνει σοβαρό, επειδή το σώμα του ασθενούς δεν έχει τις ίδιες προσαρμογές με τους υγιείς ανθρώπους.
Οι ασθενείς μπορεί να χρειαστεί να απομονωθούν όταν το ανοσοποιητικό τους σύστημα είναι ιδιαίτερα χαμηλό. Αυτό μπορεί να γίνει σε νοσοκομείο ή σε ασφαλές οικιακό περιβάλλον. Άλλοι μπορεί να συμβουλεύονται να είναι προσεκτικοί σχετικά με πιθανές πηγές έκθεσης, όπως μικρά παιδιά που μπορεί να μεταφέρουν ένα μείγμα ιών από την τάξη ή τρόφιμα που είναι γνωστό ότι μεταφέρουν μολυσματικούς οργανισμούς. Τα φάρμακα μπορεί να βελτιώσουν ένα εξασθενημένο ανοσοποιητικό σύστημα σε ορισμένες περιπτώσεις, αλλά μπορεί να χρειαστεί να εξισορροπηθούν με άλλα θέματα υγείας που θα μπορούσαν να δημιουργήσουν αντενδείξεις, όπου η χρήση του φαρμάκου δεν θα ήταν ασφαλής.