Ο προγραμματιστής κλειδιού αυτοκινήτου είναι μια συσκευή που μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την επανακωδικοποίηση του αναμεταδότη σε μηχανικό κλειδί ή μπρελόκ. Ορισμένα σύγχρονα αυτοκίνητα έχουν ειδικά κωδικοποιημένους αναμεταδότες στα κλειδιά τους και δεν θα ξεκινήσουν ή θα λειτουργήσουν εάν δεν ληφθεί το κατάλληλο σήμα. Σε ορισμένες περιπτώσεις, ένα νέο κλειδί μπορεί να προγραμματιστεί χωρίς ειδικό εξοπλισμό, αν και πολλά οχήματα απαιτούν μια συσκευή που αναφέρεται ως προγραμματιστής κλειδιού. Ένας βασικός προγραμματιστής μπορεί να είναι μια αυτόνομη μονάδα, αν και μερικές φορές ενσωματώνεται σε πολύπλοκα εργαλεία σάρωσης. Οι βασικοί προγραμματιστές συνήθως διασυνδέονται αμφίδρομα με την ενσωματωμένη υποδοχή διάγνωσης II (OBD-II).
Όταν αντικαθίσταται ένα κλειδί για ένα σύγχρονο αυτοκίνητο, η νέα μονάδα συχνά περιστρέφει τον μηχανικό διακόπτη αλλά αποτυγχάνει να προετοιμάσει το σύστημα ή να ξεκινήσει το όχημα. Εάν συμβεί αυτό, είναι συνήθως επειδή ο αναμεταδότης μέσα στο κλειδί δεν έχει κωδικοποιηθεί στο συγκεκριμένο σύστημα. Τα κλειδιά μπορούν συχνά να ληφθούν είτε από την αντιπροσωπεία είτε από έναν κλειδαρά, αν και πρέπει να κωδικοποιηθούν ανεξάρτητα από την πηγή. Ορισμένα οχήματα επιτρέπουν στον ιδιοκτήτη να κωδικοποιεί το δικό του κλειδί, κάτι που συνήθως απαιτεί την παρουσία ενός από τα αρχικά κλειδιά του. Αυτή η διαδικασία διαφέρει μεταξύ των οχημάτων, αν και συνήθως περιλαμβάνει την τοποθέτηση του αρχικού κλειδιού στην ανάφλεξη, το πάτημα ενός ειδικού συνδυασμού φρένου και πεντάλ γκαζιού και, στη συνέχεια, αντικατάσταση του αρχικού κλειδιού με το νέο, χωρίς κωδικοποίηση.
Εάν ένα όχημα δεν διαθέτει δυνατότητα αυτοπρογραμματισμού, συνήθως απαιτείται ένας βασικός προγραμματιστής για να κάνει τη δουλειά. Αυτές οι μονάδες προγραμματιστή είναι συνήθως αμφίδρομα εργαλεία OBD-II που συνδέονται στην ίδια θέση με άλλα εργαλεία σάρωσης. Πολλοί κατασκευαστές οχημάτων πωλούν μονάδες που προγραμματίζουν ειδικά κλειδιά για τα οχήματά τους, αν και μπορεί να βρεθούν και γενικές μονάδες που χειρίζονται διάφορες μάρκες και μοντέλα.
Η διαδικασία χρήσης ενός προγραμματιστή κλειδιού περιλαμβάνει συνήθως τη σύνδεση του εργαλείου στη διεπαφή OBD-II, έτσι ώστε να μπορεί να επικοινωνεί με το όχημα. Κάθε εργαλείο προγραμματιστή έχει διαφορετικές επιλογές και διαδικασίες, αν και συνήθως επιτρέπουν στον χειριστή να τραβήξει τα δεδομένα προγραμματισμού από τον υπολογιστή και στη συνέχεια να επανακωδικοποιήσει τον αναμεταδότη και τον υπολογιστή ώστε να συνεργαστούν μεταξύ τους. Αφού χρησιμοποιηθεί ο προγραμματιστής κλειδιού, το νέο κλειδί θα πρέπει να λειτουργεί όπως το παλιό.
Ορισμένα οχήματα χρησιμοποιούν μπρελόκ αντί για παραδοσιακά κλειδιά κλειδαριάς και ανατροπέα. Σε ορισμένες περιπτώσεις, το fob πρέπει να βρίσκεται μόνο σε κοντινή απόσταση από το όχημα για να λειτουργήσει, ενώ άλλα αυτοκίνητα απαιτούν να τοποθετηθεί στο ταμπλό. Οι προγραμματιστές κλειδιών μπορούν να χρησιμοποιηθούν με αυτά τα fobs σε πολλές περιπτώσεις και η διαδικασία είναι συνήθως παρόμοια με αυτή που χρησιμοποιείται με τα κανονικά πλήκτρα.