Η ανατομία του στόματος αποτελείται από τα χείλη και τα μάγουλα, τον ουρανίσκο και τη γλώσσα και τα δόντια. Ανατομικά συχνά αντιμετωπίζεται ως μέρος του πεπτικού συστήματος και μερικές φορές ονομάζεται στοματική κοιλότητα. Τα όρια της στοματικής κοιλότητας περιλαμβάνουν το άνοιγμα του φάρυγγα, τον ουρανίσκο στην οροφή το στόμα και τα χείλη μπροστά. Ορισμένα μέρη της ανατομίας του στόματος, ειδικά της γλώσσας και των χειλιών, είναι σημαντικά στην παραγωγή ήχων ομιλίας. Άλλα μέρη του στόματος συμβάλλουν στη μάσηση, το κράτημα και την κατάποση τροφής.
Τα χείλη και τα μάγουλα βοηθούν στη διατήρηση του φαγητού στη θέση του κατά τη μάσηση. Στην ανατομία του στόματος, σχηματίζουν μεγάλο μέρος του ορίου της στοματικής κοιλότητας. Τα χείλη ή τα χείλη και τα μάγουλα αποτελούνται από σκελετικούς μυς που καλύπτονται από το δέρμα. Τα χείλη σχηματίζονται από τον μυ του orbicularis oris και τα μάγουλα από τους μυς του στοματισμού. Πολλοί από τους μύες που συμμετέχουν στην έκφραση του προσώπου επηρεάζουν τις κινήσεις των χειλιών.
Ο ουρανίσκος σχηματίζει την άνω επιφάνεια της ανατομίας του στόματος. Στην πραγματικότητα αποτελείται από δύο μέρη, τον σκληρό ουρανίσκο στο μπροστινό μέρος της στοματικής κοιλότητας και τον μαλακό ουρανίσκο προς τα πίσω. Ο σκληρός ουρανίσκος είναι άκαμπτος από τα κοντινά οστά, ενώ ο μαλακός ουρανίσκος όχι.
Η γλώσσα είναι ένα μυϊκό όργανο που βοηθάει στο χειρισμό της τροφής στη μάσηση και την κατάποση. Οι εγγενείς μύες της γλώσσας μέσα στην ίδια τη γλώσσα μπορούν να αλλάξουν το σχήμα της γλώσσας για μάσημα ή ομιλία. Οι εξωγενείς μύες, οι οποίοι είναι προσαρτημένοι στο οστό, είναι υπεύθυνοι για την αλλαγή της θέσης της γλώσσας μέσα στο στόμα. Η γλώσσα καλύπτεται εν μέρει από δομές που ονομάζονται θηλές, οι οποίες σε ορισμένα σημεία περιέχουν γευστικούς κάλυκες. Αυτά καθιστούν τη γλώσσα ένα σημαντικό αισθητήριο όργανο για την αίσθηση της γεύσης.
Τα δόντια συνδέονται με τους άνω και κάτω γνάθους με συνδέσμους. Συμμετέχουν στη μάσηση με την κίνηση του κάτω οστού της γνάθου ή της κάτω γνάθου. Η ανατομία του στόματος για ενήλικες περιέχει 32 δόντια εάν περιλαμβάνονται τα δόντια σοφίας. Από μπροστά προς τα πίσω αυτά ονομάζονται κοπτήρες, δόντια σκύλου ή πτερύγια, προγόμφια ή αμφίκυλα και γομφίοι.
Οι εκτεθειμένες επιφάνειες των δοντιών ονομάζονται κορώνα και το τμήμα κάτω από τη γραμμή των ούλων ονομάζεται κορώνα. Η επιφάνεια των δοντιών καλύπτεται από σμάλτο, ένα μη ζωντανό στρώμα που αποτελείται κυρίως από ένα ορυκτό που περιέχει ασβέστιο. Κάτω από το σμάλτο βρίσκεται η οδοντίνη, η οποία σχηματίζει το μεγαλύτερο μέρος του δοντιού. Στο κέντρο βρίσκεται ο οδοντικός πολτός, ο οποίος περιέχει νεύρα που σχετίζονται με μεμονωμένα δόντια.