Το 1620, όταν οι Προσκυνητές έφτασαν στη Νέα Αγγλία, η φυλή Pequot βρισκόταν κοντά στον ποταμό Τάμεση στο Κονέκτικατ. Οι Pequot ήταν υπό την ηγεσία ενός sachem, ή επικεφαλής αρχηγού με το όνομα Sassacus. Υπήρξε μια εξέγερση στη φυλή υπό την ηγεσία ενός υπο-αρχηγού που ονομαζόταν Uncas σχετικά με το πώς να ανταποκριθεί στην ευρωπαϊκή διευθέτηση. Ο Uncas έσπασε με τους Piquet και οδήγησε τους οπαδούς του σε ένα άλλο χωριό όπου ίδρυσε τη φυλή των ιθαγενών της Αμερικής Mohegan. Ο Uncas σχημάτισε συμμαχία με τους λευκούς αποίκους και μετά την ήττα των Pequot στον πόλεμο Pequot του 1637, έγινε αρχηγός τόσο των Mohegan όσο και των υπολοίπων Pequot.
Όπως και άλλοι βόρειοι ιθαγενείς, η Φυλή των Μοχέγκαν ζούσε κατά μήκος του νερού σε γουιγγουάμ και μακρόσπιτα χτισμένα από κοντάρια καλυμμένα με φλοιό. Κυνηγούσαν, ψάρευαν, εκμεταλλεύονταν και ταξίδευαν με κανό πιρόγα από φλοιό σημύδας. Παρέμειναν σύμμαχοι των Άγγλων εναντίον των Γάλλων και κατάφεραν να διατηρήσουν τη γη και την αυτονομία τους περισσότερο από πολλούς από τους γείτονές τους, αλλά τελικά μεγάλο μέρος της γης τους καταλήφθηκε από λευκούς αποίκους.
Τον δέκατο όγδοο αιώνα, πολλά μέλη των Μοχέγκαν ασπάστηκαν τον Χριστιανισμό. Ο Samson Occum ήταν ένας από τους πρώτους Ινδούς που έγινε Χριστιανός διάκονος. Ξεκίνησε ένα χριστιανικό ινδικό σχολείο και πέρασε κάποιο διάστημα στην Αγγλία συγκεντρώνοντας χρήματα από τον Βασιλιά και άλλους προστάτες για να υποστηρίξουν την οργάνωση. Επέστρεψε στις αποικίες μόνο για να διαπιστώσει ότι το σχολείο του είχε καταληφθεί και μεταφέρθηκε στο Νιου Χάμσαϊρ, όπου τελικά έγινε Κολέγιο Ντάρτμουθ.
Το 1827 η ομοσπονδιακή κυβέρνηση απαίτησε τη μετεγκατάσταση όλων των απολίτιστων και μη χριστιανικών φυλών στα δυτικά εδάφη. Μια κληρονομιά που άφησε ο Samson Occum στο λαό του ήταν η φήμη ότι ήταν χριστιανική φυλή. Για να το ενισχύσουν αυτό, τρεις γυναίκες της φυλής ίδρυσαν την Εκκλησία των Μοχέγκαν και η Φυλή των Μόχεγκαν εξαιρέθηκε από την αναγκαστική επανεγκατάσταση.
Η φυλή των Μόχεγκαν έλαβε ομοσπονδιακή αναγνώριση ως ανεξάρτητο έθνος το 1994 και τελικά διευθέτησε τις αξιώσεις γης με το Κονέκτικατ. Το έθνος έχει σύνταγμα και διοικείται από ένα δημοκρατικά εκλεγμένο εννεαμελές φυλετικό συμβούλιο και ένα επταμελές συμβούλιο γερόντων. Το Φυλετικό Συμβούλιο επιβλέπει δικαστικά και πολιτιστικά ζητήματα και έχει νομοθετική εξουσία για τα μέλη της φυλής και την εγγραφή. Το Συμβούλιο των Δημογερόντων έχει τόσο εκτελεστική όσο και νομοθετική εξουσία σε τομείς που καθορίζονται στο σύνταγμα. Η Φυλή έχει δύο δικαστήρια: το Δικαστήριο Διαφωνιών Παιχνιδιού Μοχέγκαν, που εκδικάζει υποθέσεις σχετικά με τον τζόγο και το Δικαστήριο Φυλών Μοχέγκαν, το οποίο εκδικάζει όλα τα ζητήματα που δεν αφορούν τυχερά παιχνίδια.
Η μακροχρόνια κληρονομιά της κοινωνικής υπηρεσίας και της συμμετοχής εξακολουθεί να είναι πολύ ενεργή στη Φυλή των Μόχεγκαν. Έχουν ένα μεγάλο θέρετρο τυχερών παιχνιδιών, σπα και χώρο εστίασης και λιανικής που ονομάζεται Mohegan Sun και παρέχει θέσεις εργασίας σε πολλά μέλη της φυλής. Η φυλή χρησιμοποιεί τα έσοδα που κερδίζει για να υποστηρίξει τη δική της στέγαση και άλλες ανάγκες. Κάθε χρόνο η φυλή επιστρέφει τα τρία τέταρτα της ομοσπονδιακής χρηματικής κατανομής της για να αναδιανεμηθεί σε άλλα ινδικά έθνη που έχουν μεγαλύτερη ανάγκη.
Επιπλέον, η φυλή Mohegan και η φυλή Pequot, που κατέχουν τα δύο ινδικά καζίνο στην πολιτεία, συμφώνησαν οικειοθελώς να δώσουν το 25% των κερδών τους από τους κουλοχέρηδες στην Πολιτεία του Κονέκτικατ αντί του φόρου εταιρικών τυχερών παιχνιδιών 8%. Ως αποτέλεσμα, οι φυλές πληρώνουν πραγματικά το διπλάσιο από τον εταιρικό φόρο τους και αποτελούν τη μεγαλύτερη πηγή εσόδων για το κράτος δίπλα στην ομοσπονδιακή κυβέρνηση. Η Φυλή των Μόχεγκαν πιστεύει ότι έχει υποχρέωση να φροντίζει τους δικούς της και έχει κάνει πολλές δωρεές και επιχορηγήσεις σε σχολεία, νοσοκομεία και άλλες κοινοτικές υπηρεσίες.