Στρατιωτική φυλακή είναι μια φυλακή που κατασκευάζεται και συντηρείται από τον στρατό, η οποία μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να κρατήσει μέλη του στρατού που έχουν διαπράξει εγκλήματα σχετικά με τη στρατιωτική θητεία, αιχμαλώτους πολέμου ή άτομα που αποτελούν απειλές για την εθνική ασφάλεια. Οι συνθήκες σε αυτόν τον τύπο φυλακών και ο τρόπος με τον οποίο χρησιμοποιείται η φυλακή εξαρτώνται από την εν λόγω χώρα. Σε ορισμένες περιοχές, οι κρατούμενοι σε αυτό το είδος εγκαταστάσεων ενδέχεται να τυγχάνουν καλύτερης μεταχείρισης από τους κρατούμενους που έχουν διαπράξει άλλα εγκλήματα, ιδιαίτερα επειδή υπάρχουν συχνά αυστηροί κανόνες για την ηθική μεταχείριση των κρατουμένων που παρακολουθούνται εξωτερικά. Ακόμα κι έτσι, οι συνθήκες μέσα σε μια στρατιωτική φυλακή μπορεί να μην είναι τόσο διαφανείς όσο φαίνονται και οι κρατούμενοι μπορεί να τυγχάνουν πολύ κακής μεταχείρισης σε ορισμένες περιπτώσεις.
Οι περισσότερες χώρες έχουν κάποιου είδους στρατιωτικό σύστημα φυλακών, αλλά ορισμένες είναι πιο καθορισμένες από άλλες. Ο πρώτος τύπος στρατιωτικού κρατούμενου που στεγάζεται σε αυτόν τον τύπο φυλακών αποτελείται από άτομα που εμπλέκονται στον στρατό και έχουν διαπράξει έγκλημα που σχετίζεται με τον στρατό. Συνήθως, αυτοί οι κρατούμενοι έχουν καταδικαστεί από στρατοδικείο. Υπό αυτή την έννοια, μια στρατιωτική φυλακή μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την τιμωρία των παραβατών.
Ο άλλος τύπος κρατουμένου που στεγάζεται συχνότερα σε στρατιωτική φυλακή συνήθως δεν είναι ένοχος για διάπραξη εγκλήματος εντός του στρατού, αλλά μάλλον είναι εχθρός του έθνους ή εχθρός μαχητής. Οι αιχμάλωτοι πολέμου κρατούνται συνήθως σε αυτόν τον τύπο φυλακών, αλλά αυτό δεν είναι ένα σύστημα που έχει σχεδιαστεί ρητά για να τιμωρεί τους κρατούμενους. Υπάρχουν πολλοί διεθνείς κανόνες σχετικά με τη μεταχείριση αυτού του τύπου κρατουμένων ενώ βρίσκεται στη φυλακή και η παραβίαση αυτών των κανόνων μπορεί να έχει τρομερές συνέπειες για μια χώρα.
Ορισμένοι εγκληματίες μπορεί να θεωρηθούν ιδιαίτερα επικίνδυνοι για ένα έθνος και μπορεί επίσης να στεγαστούν σε στρατιωτική φυλακή. Αυτοί οι εγκληματίες, που μπορεί να περιλαμβάνουν τρομοκράτες ή κατασκόπους, είναι συχνά πιο ευάλωτοι σε κακή μεταχείριση από τους αιχμαλώτους πολέμου. Μερικές φορές θεωρείται αποδεκτή η ανάκριση αυτού του τύπου κρατουμένων για τη λήψη πληροφοριών. Η κρίση αυτού του τύπου εγκληματία είναι επίσης περίπλοκη, επομένως ένας κρατούμενος αυτού του είδους μπορεί να μην είναι καν ένοχος όταν οδηγείται στη φυλακή.
Η ποιότητα και η δικαιοσύνη μιας στρατιωτικής φυλακής μπορεί συχνά να θεωρηθεί ότι αντιπροσωπεύει την ηθική του ίδιου του στρατιωτικού οργανισμού. Αυτές οι φυλακές διοικούνται εξ ολοκλήρου από τον στρατό και η μεταχείριση των κρατουμένων αντανακλά τη στάση του στρατού, καθώς μπορεί να εκδηλωθεί χωρίς άμεση εποπτεία. Η εξέταση της συμπεριφοράς μέσα σε μια στρατιωτική φυλακή μπορεί επομένως να χρησιμοποιηθεί για να μιλήσουμε για αλλαγές που πρέπει να γίνουν συνολικά για να διασφαλιστεί ότι ένας στρατιωτικός οργανισμός συμπεριφέρεται δεοντολογικά σε όλες τις δραστηριότητες.