Η βακτηριακή φυσιολογία είναι η μελέτη των δομών και των λειτουργιών που επιτρέπουν στα βακτήρια να επιβιώσουν. Αυτό περιλαμβάνει τα πάντα, από τη σύνθεση των βακτηριακών κυτταρικών τοιχωμάτων μέχρι τα ένζυμα που μπορούν να παράγουν για την εκτέλεση διαφόρων εσωτερικών και εξωτερικών λειτουργιών. Οι ερευνητές σε αυτόν τον τομέα μπορούν να εργαστούν σε εργαστηριακά περιβάλλοντα, ερευνώντας γνωστούς οργανισμούς καθώς και μαθαίνοντας περισσότερα για νέα βακτήρια. Φαρμακευτικές εταιρείες, περιβαλλοντικές υπηρεσίες και πολυάριθμοι άλλοι οργανισμοί χρησιμοποιούν για βακτηριοφυσιολόγους.
Τα βακτήρια είναι εξαιρετικά διαφορετικά και μέρος του έργου της βακτηριακής φυσιολογίας περιλαμβάνει την ανάπτυξη σημαντικών κατηγοριών για να τα χωρίσουμε σε για σκοπούς ταξινόμησης και έρευνας. Για παράδειγμα, οι ερευνητές μπορούν να χωρίσουν τους οργανισμούς σε Gram θετικά και αρνητικά βακτήρια από τον τρόπο που αντιδρούν σε μια χρώση Gram. Ομοίως, μπορούν να χωριστούν σε αναερόβια βακτήρια που δεν χρειάζονται οξυγόνο για να επιβιώσουν, σε αερόβια βακτήρια και σε οργανισμούς που μπορούν να αλλάζουν μπρος-πίσω και δεν χρειάζονται αποκλειστικά οξυγονωμένο ή αποοξυγονωμένο περιβάλλον. Τα βακτήρια μπορεί επίσης να παρουσιάζουν διάφορους βαθμούς κινητικότητας και άλλα χαρακτηριστικά που μπορούν να βοηθήσουν τους ερευνητές να τα αναγνωρίσουν.
Ερευνητές στη βακτηριακή φυσιολογία εξετάζουν τη βακτηριακή γενετική και πώς τα βακτήρια ανταποκρίνονται στις εξελικτικές πιέσεις. Αναλύουν την αλληλουχία και μελετούν τα ένζυμα που παράγονται από τα βακτήρια. Αυτό περιλαμβάνει δομές απαραίτητες για κυτταρικές λειτουργίες όπως η διαίρεση καθώς και βακτηριακά ένζυμα που μπορεί να απελευθερωθούν στο περιβάλλον περιβάλλον. Ορισμένα από αυτά είναι τοξικά και μπορούν να παίξουν ρόλο σε βακτηριακές λοιμώξεις και μόλυνση. Ορισμένοι επικεντρώνονται ειδικά στις μολυσματικές ασθένειες και τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ βακτηρίων και άλλων οργανισμών.
Άλλοι ερευνητές μπορεί να διερευνήσουν θέματα όπως η συμβίωση, όπου τα βακτήρια ζουν μαζί ή με άλλους οργανισμούς για αμοιβαία οφέλη. Ορισμένοι λειχήνες, για παράδειγμα, έχουν βακτήρια ως συμβιωτικά συνεργάτες για την παροχή ενέργειας στον οργανισμό, ώστε να μπορεί να αναπτυχθεί και να αναπαραχθεί. Άλλα βακτήρια μπορεί να ζουν παρασιτικά σε άλλους οργανισμούς και μπορούν να βασίζονται σε αυτά για διατροφική υποστήριξη. Μερικά από αυτά τα παράσιτα παρέχουν οφέλη σε αντάλλαγμα, όπως οι οργανισμοί στην πεπτική οδό που βοηθούν στην πέψη, ενώ άλλα μπορεί να στραφούν στους ξενιστές τους και να προκαλέσουν ασθένεια.
Οι μαθητές που ενδιαφέρονται για τη βακτηριακή φυσιολογία θα πρέπει να παρακολουθήσουν μαθήματα βιολογίας και να παρακολουθήσουν εκπαίδευση στα βακτήρια ειδικά. Πολλοί άνθρωποι σε αυτόν τον τομέα έχουν προηγμένα πτυχία και ερευνητικές μονάδες. Οι προοπτικές απασχόλησης είναι αρκετά ποικίλες. Η τοποθεσία όπου θέλει να εργαστεί ένας επιστήμονας μπορεί να κάνει τη διαφορά, όπως και ο τομέας της ειδικότητας. Οι ερευνητές που εργάζονται σε θέματα όπως η χρήση βακτηρίων για την παραγωγή φαρμακευτικών προϊόντων μπορεί να αποφέρουν περισσότερα από άτομα που κάνουν βασική έρευνα στη βακτηριακή φυσιολογία, για παράδειγμα.