Η εισερχόμενη αισθητηριακή είσοδος κατευθύνεται στον εγκεφαλικό φλοιό μέσω μιας δομής που ονομάζεται θάλαμος. Πολλές διακριτές ομάδες νευρώνων περιλαμβάνουν τον θάλαμο, και ένας από αυτούς είναι ο έσω γεννητικός πυρήνας (MGN), που ονομάζεται επίσης έσω γεννητικό σώμα. Το MGN συμμετέχει στην ακουστική επεξεργασία και κατευθύνει την προσοχή κάποιου σε συγκεκριμένα ακουστικά ερεθίσματα. Οι υπό όρους αντιδράσεις φόβου που περιλαμβάνουν ακουστικά ερεθίσματα χρησιμοποιούν επίσης αυτή τη δομή στον εγκέφαλο.
Υπάρχουν αρκετοί υποπυρήνες μέσα στον έσω γεννητικό πυρήνα, ο καθένας με τους δικούς του εξειδικευμένους νευρώνες και λειτουργίες. Αυτές οι περιοχές έχουν πολλαπλές πηγές εισόδου, αλλά όλες λαμβάνουν πληροφορίες από το κατώτερο κολικό, την αρχική περιοχή στην οποία οι ακουστικές πληροφορίες κατευθύνονται από τον εγκέφαλο. Επιπλέον, όλοι στέλνουν προβολές στον ακουστικό φλοιό και σε άλλες περιοχές του εγκεφάλου. Η πρώτη υποπεριοχή, ο κοιλιακός υποπυρήνας, περιέχει κύτταρα που ενεργοποιούνται ως απόκριση σε ορισμένες συχνότητες ήχου. Οι πληροφορίες σχετικά με την ένταση των ήχων και πώς η συχνότητα και η ένταση διαφέρουν μεταξύ των αυτιών, μεταφέρονται επίσης στον εγκέφαλο μέσω αυτών των συγκεκριμένων κυττάρων.
Ένας άλλος υποπυρήνας του έσω γονιδιακού πυρήνα είναι ο ραχιαίος υποπύρηνος. Ορισμένα κύτταρα σε αυτήν την περιοχή φαίνεται να ανταποκρίνονται τόσο στους ήχους όσο και σε άλλες αισθητηριακές εισόδους, όπως στην αφή. Μπορεί επίσης να παίζουν ρόλο στην επεξεργασία πολύπλοκων ήχων, αφού ανταποκρίνονται σε μια ποικιλία συχνοτήτων. Αυτός ο τομέας φαίνεται να μπορεί να τροποποιηθεί με τη μάθηση.
Η τρίτη κύρια υποπεριοχή του έσω γονιδιακού πυρήνα είναι ο έσω υποπυρήνας. Τα κύτταρα σε αυτήν την περιοχή επεξεργάζονται τη διάρκεια και την ένταση του ήχου. Φαίνεται επίσης ότι ανταποκρίνονται σε μικρές περιοχές συχνοτήτων, αντί για μία μόνο συχνότητα. Άλλα αισθητήρια ερεθίσματα, όπως οι οπτικές πληροφορίες, φαίνεται να επηρεάζουν τον τρόπο με τον οποίο αυτά τα κύτταρα ανταποκρίνονται στον ήχο.
Πολλά κύτταρα στον έσω γεννητικό πυρήνα στέλνουν προβολές στην αμυγδαλή, μια περιοχή του εγκεφάλου που εμπλέκεται τόσο στη μάθηση όσο και στην έκφραση φόβων. Η ενεργοποίηση των κυττάρων στο MGN που παράγουν τον χημικό νευροδιαβιβαστή γλουταμινικό επιτρέπει να εκφραστούν οι μαθησιακές ακουστικές αποκρίσεις φόβου. Αυτά τα ίδια κύτταρα φαίνεται επίσης να εμπλέκονται στην εξαφάνιση της απόκρισης φόβου.
Τα κύτταρα στο MGN που ανταποκρίνονται στο ακουστικό στρες το κάνουν με συγκεκριμένο μοτίβο. Αυτά τα κύτταρα εμπλέκονται στη δημιουργία ορισμένου ριβονουκλεϊκού οξέος (RNA) που ονομάζεται c-fos. Αυτή η διαδικασία φαίνεται να έχει ως αποτέλεσμα την παραγωγή ορμονών του στρες, που ονομάζονται κορτικοστεροειδή, από τον υποθάλαμο. Η εκμάθηση των αποκρίσεων φόβου φαίνεται να εξαρτάται, τουλάχιστον εν μέρει, από αυτήν την αρχική επαγωγή RNA και απόκριση στρες.