Οι γενετικά τροποποιημένες καλλιέργειες είναι γεωργικά προϊόντα που έχουν υποστεί χειραγώγηση του DNA τους προκειμένου να τους προσδώσουν ορισμένα χαρακτηριστικά όπως αντοχή σε ασθένειες, παράσιτα ή ζιζανιοκτόνα. Οι καλλιέργειες τροφίμων μπορεί επίσης να κατασκευαστούν ώστε να έχουν άλλα επιθυμητά χαρακτηριστικά, όπως ταχύτερη ωρίμανση ή αυξημένο θρεπτικό περιεχόμενο. Η γενετική τροποποίηση των τροφίμων συζητείται έντονα. Περισσότερες από 40 χώρες, συμπεριλαμβανομένης της Ευρωπαϊκής Ένωσης, έχουν αυστηρούς περιορισμούς στα γενετικά τροποποιημένα τρόφιμα και ζωοτροφές, ενώ άλλες χώρες όπως η Σαουδική Αραβία, η Σρι Λάνκα και η Αλγερία έχουν απαγορεύσει εντελώς την εισαγωγή και την καλλιέργεια γενετικά τροποποιημένων καλλιεργειών.
Η παραδοσιακή εκτροφή τροφικών καλλιεργειών περιλαμβάνει την επιλογή φυτών με καλά χαρακτηριστικά όπως βελτιωμένη γεύση, απόδοση ή αντοχή σε ασθένειες και την εκτροφή τους προκειμένου να δημιουργηθούν ποικιλίες με αυτές τις ιδιότητες. Όταν οι καλλιέργειες υποβάλλονται σε γενετική μηχανική, γονίδια από έναν οργανισμό εισάγονται σε έναν άλλο οργανισμό χρησιμοποιώντας βιοτεχνολογικές τεχνικές. Για παράδειγμα, το καλαμπόκι μπορεί να γίνει ανθεκτικό σε ορισμένα έντομα με την εισαγωγή γονιδίων από ένα βακτήριο που μεταδίδεται στο έδαφος και είναι τοξικό για αυτά τα έντομα. Τα γονίδια μπορούν επίσης να αλλοιωθούν για να προκαλέσουν την καταστολή τους.
Οι εταιρείες βιοτεχνολογίας υποστηρίζουν ότι οι γενετικά τροποποιημένες καλλιέργειες θα αυξήσουν την παραγωγή τροφίμων και θα προστατεύσουν τον κόσμο από μια παγκόσμια κρίση επισιτιστικής ασφάλειας. Ισχυρίζονται ότι αυτές οι καλλιέργειες μειώνουν τη χρήση φυτοφαρμάκων επειδή δεν χρειάζεται να ψεκάζονται για έντομα, ασθένειες και επιβλαβή ζιζάνια. Όχι μόνο μπορούν να αυξηθούν οι αποδόσεις των καλλιεργειών τροφίμων, αλλά και οι θρεπτικές ιδιότητες των τροφίμων, καθώς και η γεύση και η ποιότητα.
Οι περιβαλλοντολόγοι, οι επιστήμονες, οι γιατροί και οι αγρότες υποστηρίζουν ότι υπάρχουν άγνωστες ακόμη συνέπειες για τους ανθρώπους, τη γεωργία και την παγκόσμια οικολογία. Οι πολέμιοι των γενετικά τροποποιημένων καλλιεργειών επισημαίνουν ότι υπάρχει άφθονη τροφή στον κόσμο και ότι η πείνα προκαλείται από πολιτικές και οικονομικές δυνάμεις. Ορισμένα ζιζάνια και άλλα παράσιτα γίνονται ανθεκτικά στα φυτοφάρμακα, απαιτώντας αυξημένη χρήση τους και η γύρη από τροποποιημένα φυτά μπορεί να μολύνει τις φυσικές καλλιέργειες τροφίμων. Ο Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας προειδοποιεί ότι τα γενετικά τροποποιημένα τρόφιμα ενδέχεται να αναπτύξουν πρωτεΐνες που προκαλούν νέες τροφικές αλλεργίες και αντοχή στα αντιβιοτικά.
Η αγροτική βιοποικιλότητα απειλείται μέσω της αυξημένης χρήσης γενετικά τροποποιημένων σπόρων, γεγονός που αυξάνει την πιθανότητα καλλιέργειας που δεν μπορεί να αντισταθεί σε ασθένειες και παράσιτα. Το Υπουργείο Γεωργίας των ΗΠΑ αναφέρει ότι το 2009, το 88 τοις εκατό του βαμβακιού, το 91 τοις εκατό της σόγιας και το 85 τοις εκατό του καλαμποκιού που καλλιεργείται στις ΗΠΑ είναι γενετικά τροποποιημένο. Οι εταιρείες που παράγουν αυτούς τους σπόρους έχουν διπλώματα ευρεσιτεχνίας, δίνοντας σε αυτές τις βιομηχανίες τον έλεγχο έως και το 75 τοις εκατό όλων των επεξεργασμένων τροφίμων που πωλούνται στις ΗΠΑ