Ταυτόχρονοι ερμαφρόδιτες είναι οργανισμοί που έχουν τόσο αρσενικά όσο και θηλυκά σεξουαλικά όργανα. Το πιο διάσημο παράδειγμα ταυτόχρονου ερμαφρόδιτου είναι πιθανώς το σαλιγκάρι. Όταν ζευγαρώνουν τα σαλιγκάρια, και τα δύο μέρη ανταλλάσσουν γενετικό υλικό, με το σπέρμα να περιέχεται σε «βέλη» ανθρακικού ασβεστίου. Πολλά άλλα είδη γυμνοσάλιαγκας είναι επίσης ταυτόχρονα ερμαφρόδιτα, όπως και μερικά ψάρια.
Ο όρος «ερμαφρόδιτος» χρησιμοποιείται συχνά γενικά για να περιγράψει κάθε είδους οργανισμό που έχει σεξουαλικά χαρακτηριστικά που σχετίζονται με τα δύο φύλα. Ο όρος προέρχεται από έναν χαρακτήρα της ελληνικής μυθολογίας που συγχωνεύτηκε με κάποιον του αντίθετου φύλου, δημιουργώντας ένα εντελώς νέο άτομο με αρσενικά και θηλυκά χαρακτηριστικά. Ως δευτερεύουσα σημείωση, θεωρείται προσβλητικό να χαρακτηρίσουμε ανθρώπους με αμφίσημα γεννητικά όργανα ή άμορφα σεξουαλικά χαρακτηριστικά ως «ερμαφρόδιτες». Οι περισσότεροι άνθρωποι προτιμούν να χρησιμοποιούν τον όρο «διαφυλόφιλος» για να περιγράψουν τέτοια άτομα.
Αυτός ο τύπος σεξουαλικής ανάπτυξης μπορεί να αντιπαραβληθεί με τον γονοχωρισμό, στον οποίο τα φύλα είναι ξεχωριστά και πολύ διαφορετικά. Τα περισσότερα θηλαστικά, συμπεριλαμβανομένων των ανθρώπων, είναι γονοχωριστές. Ορισμένα άλλα είδη ζώων έχουν εξελιχθεί για να καταδείξουν διαδοχικό ερμαφροδιτισμό, κατά τον οποίο το φύλο του ζώου αλλάζει κάποια στιγμή κατά τη διάρκεια της ζωής του. Οι διαδοχικοί ερμαφρόδιτες είναι συνήθως ψάρια. το ψαράκι κλόουν είναι ένα αξιοσημείωτο παράδειγμα διαδοχικού ερμαφρόδιτου.
Υπάρχουν ορισμένα ξεχωριστά εξελικτικά πλεονεκτήματα στο να είσαι ταυτόχρονος ερμαφρόδιτος. Για παράδειγμα, ορισμένα ζώα είναι ικανά να αυτο-γονιμοποιηθούν. Αυτά τα είδη μπορούν επίσης να αναπαραχθούν ταχύτερα, αφού και τα δύο εμπλεκόμενα μέρη μπορούν να παράγουν ωάρια και σπέρμα, διανέμοντας έτσι ευρύτερα το είδος. Η βλάβη στα γεννητικά όργανα του οργανισμού επίσης δεν σημαίνει πάντα το τέλος της σεξουαλικής αναπαραγωγής, επειδή ο οργανισμός έχει ένα άλλο σύνολο.
Μερικοί άνθρωποι βλέπουν επίσης τους ψευδοθερμαφρόδιτες όπως οι ύαινες ως ταυτόχρονοι ερμαφρόδιτες, επειδή φαίνεται να έχουν τα φυσικά χαρακτηριστικά φύλου και των δύο φύλων και μερικές φορές εκδηλώνουν χαρακτηριστικά συμπεριφοράς που θυμίζουν και τα δύο φύλα. Η περίπτωση των ύαινων είναι μάλλον ενδιαφέρουσα. Οι θηλυκές ύαινες αναπτύσσουν ένα είδος ψεύτικου πέους, με τις κυρίαρχες γυναίκες μερικές φορές να μιμούνται την αντρική συμπεριφορά για να επιβάλουν τη θέση τους στο πακέτο. Ωστόσο, οι ύαινες δεν είναι αληθινοί ερμαφρόδιτες, επειδή τα φύλα τους είναι όλα θηλυκά, παρά την εξωτερική εμφάνιση.
Σε ορισμένες περιπτώσεις, αυτοί οι οργανισμοί έχουν συγκεκριμένα βιολογικά μέτρα που αποτρέπουν την αυτο-γονιμοποίηση, για την αύξηση της βιοποικιλότητας. Οι γαιοσκώληκες, για παράδειγμα, είναι ταυτόχρονοι ερμαφρόδιτες, αλλά πρέπει να ζευγαρώσουν με άλλους γαιοσκώληκες για να παράγουν γονιμοποιημένα ωάρια. Άλλοι ταυτόχρονοι ερμαφρόδιτες όπως οι γυμνοσάλιαγκες μπανάνας είναι ικανοί να αυτο-γονιμοποιηθούν, αλλά είναι βιολογικά προδιάθετοι να αναζητήσουν συντρόφους.