Τα cupcakes με τυρί κρέμα είναι μικρά κέικ με τυρί κρέμα είτε στο κουρκούτι, είτε ως γέμιση είτε στο frosting. Συνήθως έχουν διάμετρο μεταξύ 2 ίντσες (5 εκατοστά) και 4 ίντσες (10 εκατοστά), αν και τα μικροσκοπικά cupcakes μπορεί να έχουν διάμετρο έως 1 ίντσα (2.5 εκατοστά). Το τυρί κρέμα παρέχει ένα πλούσιο, ξινό στοιχείο που συμπληρώνει τη γλυκύτητα πολλών συνταγών για κέικ. Αν και δεν περιέχουν όλες οι συνταγές πραγματικό τυρί κρέμα, υπάρχουν πολλές πρόσθετες γεύσεις που συχνά συνοδεύουν αυτό το είδος cupcake. Επιπλέον, υπάρχουν και άλλες ειδικές ποικιλίες που χρησιμοποιούν τη γεύση του τυριού κρέμα.
Τα cupcakes που παρασκευάζονται με τυρί κρέμα μπορεί να περιέχουν μείγμα cheesecake στο ίδιο το κέικ. Αυτό το μείγμα χρησιμοποιεί αυγά, ζάχαρη και αρωματικούς παράγοντες όπως η βανίλια για να παράγει ένα πιο αφράτο τελικό προϊόν. Οι αρτοποιοί μπορούν να στροβιλίσουν το τυρί κρέμα μέσα από τη ζύμη του κέικ, να το χρησιμοποιήσουν ως γέμιση ή να προσθέσουν μια στρώση τυριού κρέμα στην κορυφή του cupcake πριν το ψήσιμο.
Μόνο μερικές συνταγές για αυτή τη θεραπεία περιλαμβάνουν απλό τυρί κρέμα. Τα περισσότερα cupcakes με τυρί κρέμα προσθέτουν ζάχαρη, αυγά, αρώματα ή άλλα γαλακτοκομικά προϊόντα στο τυρί, αντί να το χρησιμοποιούν μόνο του. Όταν το τυρί κρέμα χρησιμοποιείται μόνο του, οι αρτοποιοί το πιέζουν συχνά στην κορυφή ενός άψητου cupcake και συμπληρώνουν με μαρμελάδα, φρούτα ή άλλο συστατικό με έντονη γεύση. Αυτό παρέχει αντίθεση και εμποδίζει τη γεύση του τυριού κρέμα να κατακλύσει το πιο ευαίσθητο κέικ.
Οι κοινές γεύσεις που συνδυάζονται με το τυρί κρέμα στα cupcakes περιλαμβάνουν τη σοκολάτα, την κολοκύθα, τις φράουλες και άλλα φρούτα και τη βανίλια. Λιγότερο κοινές προσθήκες περιλαμβάνουν καφέ, πιπεριές jalapeño και εξωτικά φρούτα όπως το γκουάβα. Τα φρέσκα φρούτα λειτουργούν καλύτερα όταν εφαρμόζονται αφού τελειώσει το ψήσιμο του cupcake, καθώς τείνει να κλαίει στο φούρνο. Όταν τα φρούτα πρέπει να μαγειρευτούν, οι αρτοποιοί χρησιμοποιούν συχνά μαρμελάδα, κονσέρβες ή σιρόπια.
Μερικοί αρτοποιοί φτιάχνουν cupcakes με τυρί κρέμα που περιέχουν τυρί κρέμα μόνο στο frosting, το οποίο συνήθως έχει γεύση βανίλιας. Τείνει να συνοδεύει κέικ κόκκινου βελούδου, σοκολάτας και καρότου, αλλά μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε κάθε είδους κέικ με έντονη γεύση. Το κρέμα τυριού frosting είναι σχετικά γλυκό, αλλά έχει μια πικάντικη νότα που λείπει από τη βουτυρόκρεμα και το ασπράδι αυγού.
Τα cheesecake cupcakes είναι ένα είδος cupcake με τυρί κρέμα που δεν περιέχει καθόλου στοιχείο κέικ. Αυτά τα μινιατούρα cheesecakes μπορούν να μαγειρευτούν στο ίδιο τηγάνι με ένα κανονικό cupcake ή σε μεμονωμένα ραμεκίν. Συχνά απαιτούν ένα λουτρό νερού για την αποφυγή ρωγμών ή ασυνεπούς υφής. Ορισμένα cupcakes με κρέμα τυριού τύπου cheesecake περιλαμβάνουν κομμάτια φρούτων ή σοκολάτας μέσα στη μερίδα cheesecake για ένα πρόσθετο γευστικό στοιχείο.
Δεδομένου ότι το τυρί κρέμα είναι ένα συστατικό υψηλής περιεκτικότητας σε λιπαρά, τα περισσότερα cupcakes που παρασκευάζονται με αυτό είναι ενεργειακά πυκνά. Ορισμένες συνταγές χρησιμοποιούν τυρί κρέμα με χαμηλά λιπαρά για να κάνουν το cupcake πιο υγιεινό, αλλά τα αυγά, το βούτυρο και το λάδι στα περισσότερα cupcakes τα κάνουν λιπαρά και πολύ θερμιδικά. Οι βίγκαν και τα άτομα με ευαισθησία στα γαλακτοκομικά μπορούν να αντικαταστήσουν το vegan τυρί κρέμα, που παρασκευάζεται από σπόρους σόγιας, με το παραδοσιακό τυρί κρέμα γάλακτος.