Τα αντισώματα είναι πρωτεΐνες σε σχήμα Υ στην επιφάνεια των Β λεμφοκυττάρων που χρησιμοποιούνται από το ανοσοποιητικό σύστημα για την καταπολέμηση παθογόνων μικροοργανισμών. Τα πεπτιδικά αντισώματα κατασκευάζονται ειδικά από τον οργανισμό για την καταπολέμηση των ασυνήθιστων μορφών πεπτιδίων που παράγονται από άρρωστα κύτταρα του σώματος ή παθογόνα. Η παρουσία ορισμένων τύπων πεπτιδίων στα κύτταρα προκαλεί την αποστολή πεπτιδικών αντισωμάτων για την εξάλειψή τους. Οι ερευνητές χρησιμοποιούν πεπτιδικά αντισώματα για να ανιχνεύσουν και να αναγνωρίσουν ασθένειες όπως η ρευματοειδής αρθρίτιδα.
Τα αντισώματα κιτρουλίνης είναι πεπτιδικά αντισώματα που αποστέλλονται για να επιτεθούν στο αμινοξύ κιτρουλίνη σε κυκλικά ή σε σχήμα δακτυλίου πεπτίδια. Το αμινοξύ κιτρουλίνη κανονικά δεν βρίσκεται στο σώμα. Συνήθως γίνεται μόνο όταν ο οργανισμός μετατρέπει το αμινοξύ ορθιθίνη σε αργινίνη. Η παρουσία παρατεταμένης κιτρουλίνης στα πεπτίδια προκαλεί το σχηματισμό ενός αντισώματος κιτρουλίνης που αποστέλλεται για να το εξαλείψει.
Όταν κάποιος πάσχει από ασυνήθιστη φλεγμονή των αρθρώσεων ή αρθρίτιδα, ο γιατρός του μπορεί να ζητήσει μια εξέταση αίματος που αναζητά αντισώματα κιτρουλίνης. Το αντίσωμα κιτρουλίνης ονομάζεται συχνά ρευματοειδής παράγοντας. Αυτό συμβαίνει επειδή αντισώματα κιτρουλίνης υπάρχουν σε έως και 80 τοις εκατό των ατόμων με ρευματοειδή αρθρίτιδα, μια αυτοάνοση ασθένεια που προσβάλλει τις αρθρώσεις του σώματος. Το επίπεδο των αντισωμάτων κιτρουλίνης που ανιχνεύονται στον οργανισμό τείνει να συσχετίζεται με τη σοβαρότητα της νόσου.
Τα Β λεμφοκύτταρα με αντισώματα σε σχήμα Υ απελευθερώνονται στην κυκλοφορία του αίματος ή στα λεμφικά υγρά του σώματος ως απόκριση σε ένα αντιγονικό ερέθισμα. Το αντιγονικό ερέθισμα μπορεί να είναι ένας ιός, παράσιτο, βακτηρίδιο, μεταμοσχευμένο όργανο ή άλλος ξένος παράγοντας. Οι κορυφαίοι βραχίονες του αντισώματος σε σχήμα Υ συνδέονται με το αντιγονικό ερέθισμα και το εξουδετερώνουν ή το μετακινούν σε ένα λευκό αιμοσφαίριο γνωστό ως μακροφάγο που πρόκειται να καταστραφεί. Στην περίπτωση των πεπτιδικών αντισωμάτων, το αντίσωμα συνδέεται με ένα συγκεκριμένο πεπτίδιο σε ένα παθογόνο.
Ο μυελός των οστών δημιουργεί Β λεμφοκύτταρα. Μετατρέπονται σε κύτταρα πλάσματος που είναι ικανά να παράγουν πολλούς διαφορετικούς τύπους αντισωμάτων. Κάθε αντίσωμα έχει σχεδιαστεί για να επιτίθεται σε έναν συγκεκριμένο τύπο αντιγόνου.
Ένα εμβόλιο για έναν ιό δημιουργείται με την απενεργοποίηση ενός παθογόνου και την ένεση του σε ένα ανθρώπινο σώμα. Τα Β λεμφοκύτταρα ανιχνεύουν τα απενεργοποιημένα αντιγόνα και στέλνουν αντισώματα μέχρι να μάθουν ποιοι τύποι αντισωμάτων καταστρέφουν τα αντιγόνα. Στην ουσία, ένα εμβόλιο προστατεύει ένα άτομο από μόλυνση διδάσκοντας στα αντισώματα πώς να συγκρατούν και να καταστρέφουν έναν νέο τύπο μικροσκοπικού παθογόνου.