Τα σκάφη πολλαπλού κύτους είναι σκάφη που προορίζονται για ναυσιπλοΐα σε ύδατα που διαθέτουν περισσότερα από ένα κύτος ή υδατοστεγές σώμα. Τα καταμαράν είναι ίσως τα πιο αναγνωρίσιμα σκάφη πολλαπλού κύτους, αν και υπάρχουν άλλα στυλ για συγκεκριμένους σκοπούς. Ένας σκάφος μπορεί να επιλέξει ένα τέτοιο σχέδιο για να βελτιώσει τη σταθερότητα, ειδικά σε τραχιά νερά και σε υψηλές ταχύτητες, και για να μεγιστοποιήσει τον αποτελεσματικό χώρο στο κατάστρωμα. Τα πορθμεία σχεδιάζονται συνήθως με περισσότερα από ένα κύτος για να βελτιώνουν την ταχύτητα και τη σταθερότητα και να επιτρέπουν περισσότερο χώρο μεταφοράς επιβατών στο κατάστρωμα. Πολλά πλοία μεταφέρουν επίσης αυτοκίνητα, επομένως ο επιπλέον χώρος στο κατάστρωμα είναι ιδιαίτερα σημαντικός.
Τα καταμαράν είναι σκάφη πολλαπλών σκαφών που διαθέτουν δύο ξεχωριστά σκάφη προσανατολισμένα παράλληλα. Ένα κατάστρωμα ή πλαίσιο τρέχει ανάμεσα στα δύο κύτους, και εδώ θα τοποθετηθούν οι επιβάτες και το φορτίο ενώ το σκάφος βρίσκεται σε κίνηση. Αυτό το σχέδιο είναι σταθερό και γρήγορο. η ποσότητα της οπισθέλκουσας μέσω του νερού μειώνεται επειδή οι γάστρες δεν βυθίζονται τόσο μακριά στο νερό όσο είναι επιρρεπές σε ένα μεγαλύτερο σκάφος μονού κύτους. Αυτά τα σκάφη πολλαπλού κύτους μπορεί να είναι μηχανοκίνητα ή να είναι ιστιοκίνητα. Τα μικρότερα σκάφη πολλαπλού κύτους είναι πιο πιθανό να είναι ιστιοκίνητα, αν και όχι αποκλειστικά.
Ένα τριμαράν είναι παρόμοιο στο σχεδιασμό με ένα καταμαράν, αλλά αντί να διαθέτει δύο γάστρα, το τριμαράν έχει τρεις. Η λειτουργία αυτών των σκαφών πολλαπλού κύτους είναι κάπως διαφορετική από αυτή ενός καταμαράν. Το τριμαράν διαθέτει κύριο κύτος στο κέντρο του σκάφους και δύο μικρότερα κύτη που εκτείνονται από εκατέρωθεν του κύριου σκάφους. Οι εξάρσεις συνδέονται με την κύρια γάστρα με μακριές αντηρίδες. Ένα trimaran είναι πολύ πιο γρήγορο και πιο σταθερό από ένα σκάφος μονού κύτους, αν και είναι κάπως πιο δύσκολο να χειριστείτε αυτό το σκάφος λόγω του εξαιρετικού πλάτους του. Ενώ το trimaran μπορεί να πλοηγηθεί σε πιο ρηχές πλωτές οδούς από ένα σκάφος μονού κύτους, δεν θα είναι σε θέση να πλοηγηθεί σε στενές πλωτές οδούς όπου ένα σχέδιο ενός κύτους μπορεί να λειτουργήσει μια χαρά.
Τα μικρότερα σκάφη, όπως τα κανό, μπορούν επίσης να διαθέτουν σχέδιο πολλαπλού κύτους. Ορισμένα κανό που έχουν σχεδιαστεί για ιστιοπλοΐα θα διαθέτουν ένα ή περισσότερα μικρά εξάρματα που εκτείνονται από το κύριο κύτος του σκάφους. Αυτό γίνεται για να βοηθήσει στη σταθερότητα σε τραχιά νερά ή δυνατούς ανέμους. Τα καγιάκ μπορεί επίσης να διαθέτουν μικρά εξώφυλλα σχεδιασμένα για τους ίδιους σκοπούς. Αυτά τα εξαρτήματα είναι συνήθως αφαιρούμενα, ώστε το σκάφος να μπορεί να κωπηλατεί ελεύθερα όταν δεν απαιτείται επιπλέον σταθερότητα. Αυτά τα αξεσουάρ είναι επομένως συνήθως ελαφριά και συμπαγή.