Υπάρχουν διάφοροι τύποι εντερικών βακτηρίων που ζουν μέσα στο ανθρώπινο σώμα, με μερικά να είναι χρήσιμα για την πεπτική διαδικασία και άλλα να είναι δυνητικά καταστροφικά, ειδικά όταν υπάρχουν σε μεγάλους αριθμούς. Τα προβιοτικά είναι χρήσιμες μορφές εντερικών βακτηρίων, όπως και ορισμένα στελέχη E. coli και ορισμένες μορφές στρεπτόκοκκου. Οι επιβλαβείς τύποι βακτηρίων περιλαμβάνουν το ελικοβακτηρίδιο του πυλωρού, τη σαλμονέλα και ορισμένα στελέχη του E. coli. Οποιεσδήποτε εξατομικευμένες ερωτήσεις σχετικά με τα εντερικά βακτήρια θα πρέπει να συζητούνται με γιατρό ή άλλο επαγγελματία ιατρό.
Τα προβιοτικά όπως ο Lactobacillus και τα Bifidobacteria είναι φυσικοί τύποι χρήσιμων εντερικών βακτηρίων. Οι ασθένειες ή οι ακατάλληλες διατροφικές συνήθειες μπορούν να διαταράξουν την ισορροπία των υγιών έναντι των ανθυγιεινών βακτηρίων στον εντερικό σωλήνα. Για το λόγο αυτό, τα προβιοτικά συμπληρώματα έχουν γίνει ένας ολοένα και πιο δημοφιλής τρόπος για να βοηθήσει στην αποκατάσταση της φυσικής ισορροπίας των βακτηρίων του εντέρου. Αυτά τα συμπληρώματα είναι διαθέσιμα στα περισσότερα φαρμακεία και δεν απαιτούν συνταγή από γιατρό, αν και είναι πάντα συνετό να συμβουλευτείτε έναν γιατρό πριν ξεκινήσετε οποιοδήποτε είδος συμπληρώματος διατροφής.
Η σαλμονέλα είναι ένας τύπος επιβλαβούς εντερικού βακτηρίου που συνήθως εισέρχεται στο σώμα ως αποτέλεσμα τροφικής δηλητηρίασης. Οι κοιλιακές κράμπες, ο πυρετός και η διάρροια είναι τα συνήθη συμπτώματα της δηλητηρίασης από σαλμονέλα. Στις περισσότερες περιπτώσεις, τα συμπτώματα εξαφανίζονται από μόνα τους μέσα σε λίγες ημέρες, αν και μερικές φορές μπορεί να καταστεί απαραίτητη ιατρική παρέμβαση. Σοβαρές περιπτώσεις σαλμονέλας μπορεί να προκαλέσουν ακραία ασθένεια ή ακόμα και θάνατο, επομένως τυχόν ύποπτα συμπτώματα δηλητηρίασης από σαλμονέλα θα πρέπει να αναφέρονται σε γιατρό για περαιτέρω ιατρική αξιολόγηση.
Ορισμένα στελέχη του βακτηρίου E. coli είναι πραγματικά χρήσιμα για τη διατήρηση ενός υγιούς πεπτικού συστήματος, ενώ άλλα στελέχη μπορούν να προκαλέσουν μέτρια έως σοβαρή ασθένεια. Πηγές αυτού του τύπου επιβλαβών εντερικών βακτηρίων περιλαμβάνουν το μη μαγειρεμένο κρέας και τα προϊόντα που έχουν έρθει σε επαφή με μολυσμένα κόπρανα. Μερικά από τα πιο κοινά συμπτώματα της δηλητηρίασης από E. coli περιλαμβάνουν επώδυνες εντερικές κράμπες, αιματηρή διάρροια και πυρετό. Σε πολλές περιπτώσεις, τα συμπτώματα εξαφανίζονται μέσα σε μερικές εβδομάδες χωρίς ιατρική παρέμβαση, αν και μπορεί να εμφανιστούν δυνητικά θανατηφόρες επιπλοκές.
Η λιστέρια είναι ένας τύπος επιβλαβών εντερικών βακτηρίων που εντοπίζεται μερικές φορές στο νερό ή το έδαφος και μπορεί να μολύνει σχεδόν οποιοδήποτε είδος τροφίμου. Τα συμπτώματα της δηλητηρίασης από λιστέρια συχνά ξεκινούν ως συμπτώματα που μοιάζουν με γρίπη, όπως πυρετός και κόπωση. Η καρδιά, το συκώτι και ο σπλήνας μπορεί αργότερα να διευρυνθούν και ο ασθενής να αρρωστήσει βαριά, συχνά απαιτώντας νοσηλεία. Οι έγκυες γυναίκες είναι ιδιαίτερα ευάλωτες σε αυτό το είδος βακτηριακής λοίμωξης, ειδικά όταν καταναλώνουν μη μαγειρεμένο κρέας ή υποεπεξεργασμένο γάλα ή προϊόντα.