Η έμφυλη αυτοκτονία αναφέρεται στη δολοφονία μιας μαζικής ομάδας ανθρώπων με βάση το φύλο. Η πιο κοινή μορφή κατά των θηλυκών, που ονομάζεται γυναικοκτονία, είναι η θανάτωση κοριτσιών ή η αποβολή θηλυκών εμβρύων σε πολιτισμούς όπου προτιμώνται τα αρσενικά παιδιά. Η πιο κοινή μορφή κατά των αρσενικών, που ονομάζεται ανδροκτόνος, εμφανίζεται στο πλαίσιο του πολέμου. Η έμφυλη αυτοκτονία κατά των ανδρών πραγματοποιείται συνήθως ως μέσο για να αποδυναμωθεί η ικανότητα ενός καταπιεσμένου λαού να πολεμήσει ή να αποδυναμώσει έναν εχθρό πριν από τη μάχη.
Ο όρος gendercide χρησιμοποιήθηκε για πρώτη φορά από τη Mary Anne Warren στο βιβλίο της Gendercide: The Implications of Sex Selection το 1985. Στο βιβλίο, συγκρίνει τη μαζική δολοφονία με βάση το φύλο με τη γενοκτονία, η οποία ορίζεται ως η σκόπιμη και συστηματική δολοφονία μιας πολιτιστικής ή φυλετικής ομάδας ανθρώπων. Το βιβλίο του Warren εστιάζει στην έμφυλη ανθρωποκτονία κατά των γυναικών, αναφέροντας ως παραδείγματα το κυνήγι μαγισσών και άλλες μαζικές δολοφονίες γυναικών σε όλη την ιστορία.
Η συγγραφέας Carol Orlock πιθανότατα εισήγαγε τον όρο γυναικοκτονία το 1974. Εκτός από τη συνεχιζόμενη δολοφονία θηλυκών βρεφών και την έκτρωση θηλυκών εμβρύων, οι σύγχρονες μορφές γυναικοκτονίας μπορεί να περιλαμβάνουν νομικά επικυρωμένες θανατικές ποινές για συζύγους που κατηγορούνται για μοιχεία, θανάτους γυναικών και κοριτσιών που προκαλούνται από παραμέληση και κακοποίηση, και τις δολοφονίες γυναικών με τη λεγόμενη δολοφονία ντροπής. Οι δολοφονίες ντροπής ή οι δολοφονίες τιμής είναι αποδεκτές, ακόμη και νόμιμες, σε ορισμένους πολιτισμούς και οδηγούν σε δολοφονίες γυναικών ή κοριτσιών λόγω αντιληπτών σεξουαλικών ανάρμοστων επειδή υπήρξαν θύματα βιασμού ή άλλης σεξουαλικής επίθεσης ή επειδή με κάποιο άλλο τρόπο ατίμασαν τις οικογένειές τους .
Όπως και η γενοκτονία κατά των γυναικών, η μαζική δολοφονία ανδρών με βάση το φύλο χρονολογείται από την αρχαιότητα. Ο Ποσειδώνας οδηγεί μια σφαγή κατά των αρσενικών στη μυθολογία. Υπάρχουν αφηγήσεις σε όλη τη Βίβλο. Στη σύγχρονη εποχή, η έμφυλη ανθρωποκτονία κατά των ανδρών συνεχίζει να συμβαίνει κυρίως στο πλαίσιο του πολέμου ή να αποδυναμώνει μια κοινωνία οικονομικά, επειδή οι άνδρες συνεχίζουν να είναι πρωτίστως υπεύθυνοι για την οικονομική υποστήριξη της οικογένειας σε πολλά μέρη του κόσμου.
Το πιο ευρέως αναγνωρισμένο παράδειγμα έμφυλης ανθρωποκτονίας στη σύγχρονη εποχή οδήγησε στο φαινόμενο των αγνοουμένων γυναικών στην Ασία, με την αναλογία γυναικών προς άνδρες να είναι σημαντικά διαφορετική από αυτή που θα περίμενε κανείς. Χωρίς θανάτωση με βάση το φύλο, μια κοινωνία έχει γενικά ελαφρώς περισσότερες γυναίκες από άντρες. Συγκριτικά, υπάρχουν περίπου 10 τοις εκατό λιγότερες γυναίκες από τους άνδρες σε πολλά μέρη της Ασίας. Ορισμένες μελέτες δείχνουν ότι υπάρχουν έως και 100 εκατομμύρια γυναίκες «αγνοούμενες» στην Ασία από το 2011.