Ο όρος χλωρίδα χρησιμοποιείται συχνά για να καλύψει όλα τα φυτά, τους μύκητες και τα φύκια σε ένα δεδομένο περιβάλλον, ενώ η πανίδα αναφέρεται στα ζώα που ζουν εκεί. Ο επιστημονικός ορισμός της χλωρίδας και της πανίδας είναι τα φυτά και τα ζώα που ζουν σε μια συγκεκριμένη περιοχή ή εποχή. Η διαφορά μεταξύ τους πηγάζει από το αν συζητούνται φυτά ή ζώα.
Στη βοτανική, ή στη μελέτη των φυτών, η χλωρίδα έχει στην πραγματικότητα δύο διακριτούς ορισμούς. Πρώτον, μπορεί να σημαίνει τα φυτά ενός δεδομένου περιβάλλοντος ή χρονικής περιόδου, όπως αναφέρεται παραπάνω, ή μπορεί να αναφέρεται σε ένα βιβλίο ή ένα τέτοιο έργο που περιγράφει φυτά με σκοπό την αναγνώριση. Αυτός ο πρώτος ορισμός είναι ο πιο κοινός και αναφέρεται συγκεκριμένα σε εκείνα τα είδη φυτών που είναι αυτόχθονα στην περιοχή ή την εποχή. Ένα γηγενές είδος, φυτικό ή ζωικό, είναι αυτό που προέρχεται από μια περιοχή και συνεχίζει να αναπτύσσεται και να επιβιώνει εκεί χωρίς καμία ανθρώπινη παρέμβαση. Το αντίθετο από τα αυτόχθονα είδη είναι τα εισαγόμενα.
Τόσο η χλωρίδα όσο και η πανίδα έχουν περαιτέρω ταξινομήσεις ή υποδιαιρέσεις. Οι ταξινομήσεις της χλωρίδας εξαρτώνται από την περιοχή, το κλίμα, το περιβάλλον και την περίοδο των φυτών που περιγράφονται. Οι υποδιαιρέσεις της πανίδας βασίζονται κυρίως στο πού ζουν τα ζώα και στο μέγεθός τους.
Υπάρχουν πολλές διαφορετικές περιοχές χλωρίδας σε ολόκληρο τον πλανήτη. Ορισμένες περιοχές μπορεί να είναι τόσο μεγάλες όσο ολόκληρες ηπείρους ή τόσο μικρές όσο ένας υγρότοπος ή ορεινές περιοχές. Εκτός από τις γεωγραφικές περιοχές, το κλίμα και οι χρονικές περίοδοι μπορούν να ομαδοποιήσουν διαφορετικά φυτά σε χλωρίδες. Τα φυτά μπορούν επίσης να ομαδοποιηθούν σε αυτοφυή, γεωργική και κηπευτική χλωρίδα και ζιζανίων.
Υπάρχουν επτά διαφορετικές υποδιαιρέσεις της πανίδας που χρησιμοποιούνται, με βάση το πού εμφανίζονται τα ζώα και το μέγεθός τους. Η Infauna και η Epifauna είναι υδρόβια ζώα που ζουν εντός ή στον πυθμένα του ωκεανού, αντίστοιχα. Η μικροπανίδα είναι μικροσκοπικού μεγέθους, ενώ η μειοπανίδα είναι ελαφρώς μεγαλύτερη και ζει τόσο σε εδαφικά περιβάλλοντα πώλησης όσο και σε περιβάλλοντα γλυκού νερού. Η μακροπανίδα είναι μικροσκοπικοί οργανισμοί του εδάφους, μεγαλύτεροι από τη μειοπανίδα, αλλά μικρότεροι από τους γαιοσκώληκες και τους νηματώδεις, που ανήκουν στην ομάδα της μεσοπανίδας. Μεγαπανίδα είναι τα μεγάλα ζώα του συγκεκριμένου περιβάλλοντος που συζητούνται.
Τόσο η χλωρίδα όσο και η πανίδα μιας περιοχής μελετώνται χωριστά και μαζί από διάφορους διαφορετικούς τύπους επιστημόνων. Οι βοτανολόγοι, ή οι επιστήμονες των φυτών, μελετούν κυρίως τη χλωρίδα, ενώ οι ζωολόγοι την πανίδα. Οι οικολόγοι και εκείνοι που μελετούν τη διατήρηση εξετάζουν και τα δύο μαζί, καθώς οι δύο ομάδες εξαρτώνται η μία από την άλλη για να επιβιώσουν.