Στις Ηνωμένες Πολιτείες, το Εθνικό Σύστημα Ταυτοποίησης Ζώων είναι ένα πρόγραμμα που προορίζεται να παρακολουθεί έναν αριθμό διαφορετικών ζώων, μερικά τα οποία προορίζονται να πωληθούν για τροφή εμπορικά και άλλα όχι. Αυστηρά μιλώντας, το πρόγραμμα είναι εθελοντικό. Ωστόσο, πολλά κυβερνητικά προγράμματα και ορισμένα είδη γεωργικών ενισχύσεων συνδέονται με τη συμμετοχή στο πρόγραμμα, γεγονός που καθιστά δύσκολο για τους κτηνοτρόφους να μην εμπλακούν κάποια στιγμή.
Ο κύριος στόχος του Εθνικού Συστήματος Αναγνώρισης Ζώων είναι να επιτρέψει την παρακολούθηση των ζώων σε περίπτωση εκδήλωσης επιδημίας ασθένειας. Σε τέτοιες περιπτώσεις, ο προσδιορισμός της προέλευσης των ζώων θα μπορούσε να είναι εξαιρετικά σημαντικός για τον προσδιορισμό του ποια άλλα ζώα μπορεί να επηρεαστούν. Σε ορισμένες περιπτώσεις, αυτό θα μπορούσε να επηρεάσει ολόκληρη την προσφορά τροφίμων.
Όταν εμφανίζεται μια επιδημία ασθένειας, οι υπεύθυνοι υγείας πρέπει να γνωρίζουν τρεις κρίσιμες πληροφορίες. Το πρώτο είναι ποια ζώα μολύνθηκαν ή ενεπλάκησαν στο ξέσπασμα. Το δεύτερο είναι η τοποθεσία αυτών των μολυσμένων ζώων. Το τρίτο είναι τι άλλα ζώα μπορεί να έχουν εκτεθεί στην ασθένεια. Το Εθνικό Σύστημα Αναγνώρισης Ζώων θα βοηθούσε στον εντοπισμό και των τριών αυτών των πληροφοριών.
Ένα από τα βασικά χαρακτηριστικά του Εθνικού Συστήματος Αναγνώρισης Ζώων είναι η παρακολούθηση των ζώων στο σύστημα. Κάθε φορά που ένα ζώο πωλείται ή μετακινείται, το Εθνικό Σύστημα Ταυτοποίησης Ζώων σημειώνει αυτό το γεγονός. Σε κάποιο σημείο, αυτές οι πληροφορίες μπορούν να χρησιμοποιηθούν στην επισήμανση, ώστε όλοι οι καταναλωτές να γνωρίζουν πού βρισκόταν το κρέας σε ποιο στάδιο της διαδικασίας, τόσο ζωντανό όσο και μετά το σφαγιασμό.
Οι κριτικές για το Εθνικό Σύστημα Αναγνώρισης Ζώων επικεντρώνονται στους τύπους των ζώων που απαιτείται να παρακολουθούνται και στα αντιληπτά διπλά πρότυπα μεταξύ των εταιρικών εκμεταλλεύσεων και των μικρότερων οικογενειακών εκμεταλλεύσεων. Όλα τα ζώα εκτροφής μπορεί να χρειαστεί να επισημανθούν από αυτούς που συμμετέχουν. Ωστόσο, οι μεγαλύτερες φάρμες μπορούν να αναγνωρίσουν τα ζώα τους στο σύνολό τους, όχι μεμονωμένα, κάτι που μπορεί να τους προσφέρει ένα πλεονέκτημα. Επιπλέον, όλα τα μεγάλα ζώα εκτροφής, ακόμη και αυτά που δεν χρησιμοποιούνται για τροφή, θα πρέπει να είναι στο πρόγραμμα, προσθέτοντας επιπλέον κόστος στο πρόγραμμα.
Επιπλέον, εκείνοι που αντιτίθενται στο Εθνικό Σύστημα Ταυτοποίησης των Ζώων λένε ότι θα αυξήσει μόνο το κόστος των τροφίμων και τη γραφειοκρατία της κυβέρνησης. Αν και μπορεί να κάνει το σύστημα τροφίμων ασφαλέστερο, τα τέλη που σχετίζονται με την ταυτοποίηση κάθε ζώου θα μεταβιβαστούν στον καταναλωτή, λένε οι επικριτές. Κάτι τέτοιο θα βλάψει μόνο τη βιομηχανία τροφίμων των ΗΠΑ και θα καταστήσει δυσκολότερο τον ανταγωνισμό στο εξωτερικό, υποστηρίζουν. Ωστόσο, ορισμένες αγορές του εξωτερικού απαιτούν ένα σύστημα αναγνώρισης που να περιγράφει λεπτομερώς κάθε κίνηση, λόγω του φόβου της σπογγώδους εγκεφαλίτιδας των βοοειδών, γνωστή ως ασθένεια των τρελών αγελάδων, και άλλων κοινών ζωικών ασθενειών.