Definiowanie ekonometrii strukturalnej jest zwykle najlepsze, gdy najpierw rozumie się oba terminy indywidualnie w kontekście ekonomii. Termin ekonometria zwykle oznacza połączenie teorii ekonomii i metod statystycznych podczas analizy danych. Strukturalne potocznie odnosi się do estymacji, czyli celowego zastosowania teorii ekonomii w modelowaniu badań empirycznych. Dlatego ekonometria strukturalna jest często definiowana jako badania empiryczne, które wykorzystują teorię ekonomiczną do modelowania i analizy wyników. Niektórzy ekonomiści uważają tę metodę za przydatną do wyciągania zwięzłych wniosków między relacjami a założeniami ekonomicznymi, statystycznymi i instytucjonalnymi.
Modelowanie strukturalne może się różnić w zależności od tego, kiedy projekt badawczy jest projektowany. Badacze mają dużą elastyczność w określaniu, ile teorii ekonomicznej należy włączyć do projektu i analizy. Mają również dużą elastyczność w określaniu, jak bardzo polegać na założeniach statystycznych, a ta ostateczna użyteczność metody jest zwykle oparta na kompromisie. Niezgodność na temat dostępnych wyborów i sytuacji, w których należy je wybierać, jest rutyną, a często dyskutuje się o kompromisach poczynionych w projektach badawczych, ponieważ nie ma konkretnych zasad. Mimo to skupienie się na ekonometrii strukturalnej wydaje się oferować pewne wyraźne korzyści.
Domyślnie skutkuje powiązaniem modeli statystycznych i teorii ekonomii w podejściach niestrukturalnych, przy czym teoria ekonomii często nie jest nawet obecna na kursach ekonometrii na studiach. Wyraźnie jest celem podejścia strukturalnego, skłaniającego badaczy do tworzenia powiązań między ekonomią, statystyką a światem rzeczywistym. Dlatego ekonometria strukturalna potencjalnie zapewnia pewne wyraźne korzyści.
Jedną z takich zalet jest estymacja parametrów strukturalnych, pozwalająca jednocześnie na wykorzystanie eksperymentów licznikowych, symulacji i porównywania statystyk. Pozwala również na porównanie różnych teorii zastosowanych do projektu badawczego, a jednoznaczne założenia zapewnią również głębszy wgląd w mechanizmy, które wpływają na wyniki. Zastosowanie ekonometrii strukturalnej jest często wykorzystywane w projektach dotyczących teorii gier w celu zrozumienia podaży i popytu rynkowego, a także wielu innych działań badawczych, w których wyraźne wyniki są pomocne, a nie przeszkodą.
Jednak podejścia niestrukturalne wykonują jedną z trzech rzeczy: poleganie na statystyce będzie miało niewielki lub żaden wkład z teorii ekonomii, polega na teorii ekonomii z niewielkim wkładem lub zerowym ze statystykami lub zawiera minimalną fuzję tych dwóch. Przykłady badań niestrukturalnych obejmują prognozowanie, które opiera się na statystyce i badaniach pomiarowych, takich jak PKB, który opiera się na teorii ekonomii. Ocena polityki przenika zarówno teorię ekonomiczną, jak i statystykę poprzez szacowanie przypadkowych skutków, ale nie jest uważana za ekonometrię strukturalną, ponieważ zwykle przyjmuje minimalne założenia . Z koncepcyjnego punktu widzenia oznacza to, że prace niestrukturalne i konstrukcyjne różnią się zasadniczo, ale nie zawsze mają zastosowanie, ponieważ linie znacznie się rozmywają.