Οι μυκοτοξίνες είναι τοξικές ουσίες που παράγονται από μύκητες, συνήθως ως δευτερογενή μεταβολικά προϊόντα. Αυτές οι τοξίνες παρουσιάζουν μεγάλο ενδιαφέρον για τον άνθρωπο επειδή μπορούν να προκαλέσουν ασθένεια ή ακόμα και θάνατο στους ανθρώπους, αλλά μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν ποικίλα. Ορισμένα καλούπια Penicillium, για παράδειγμα, παράγουν μυκοτοξίνες που είναι επιβλαβείς για τα βακτήρια. Η μελέτη των μυκοτοξινών έχει προχωρήσει με αλματώδη βήματα στο εργαστήριο από τα μέσα του 20ού αιώνα, όταν οι άνθρωποι άρχισαν να αντιλαμβάνονται την έκταση των μυκοτοξινών στο περιβάλλον.
Η παραγωγή τοξινών δεν είναι ασυνήθιστη στη φύση. Πολλοί οργανισμοί κάνουν τις τοξίνες για να γίνουν λιγότερο ελκυστικοί, διασφαλίζοντας ότι θα ζήσουν για να μεταδώσουν το γενετικό τους υλικό, αντί να φαγωθούν. Σε άλλες περιπτώσεις, η τοξίνη είναι ένα καθαρά τυχαίο υποπροϊόν του μεταβολισμού του οργανισμού. Οι μύκητες παράγουν μερικές τοξίνες κατά τύχη κατά τη διαδικασία κατασκευής των αμινοξέων που χρησιμοποιούν για να αφομοιώσουν τα υλικά που τρώνε. Κάπως ασυνήθιστα, οι μύκητες χωνεύουν τα πράγματα πριν από το φαγητό, απελευθερώνοντας αμινοξέα σε οργανική ύλη για να διασπαστούν πριν το καταναλώσουν.
Τα δηλητηριώδη μανιτάρια είναι διάσημα στους ανθρώπους για τις μυκοτοξίνες τους. Ένας μεγάλος αριθμός μανιταριών περιέχει ενώσεις που προκαλούν γαστρεντερική δυσφορία, αλλά μερικά έχουν πιο επικίνδυνες τοξίνες, όπως η άλφα-αμανιτίνη, η μυκοτοξίνη που υπάρχει σε ορισμένα μανιτάρια Amanita. Ορισμένα μανιτάρια περιέχουν ένα κοκτέιλ μυκοτοξινών το οποίο είναι εγγυημένο ότι θα προκαλέσει τουλάχιστον κάποια εντερική βουή, αν όχι πιο σοβαρά συμπτώματα.
Η ευαισθητοποίηση σχετικά με τις μυκοτοξίνες που παράγονται από μούχλες έχει επίσης αυξηθεί από τη δεκαετία του 1980, όταν οι άνθρωποι άρχισαν να αναγνωρίζουν τον κίνδυνο επικίνδυνων μούχλας. Ορισμένα καλούπια που μολύνουν τους τοίχους, τα χαλιά και ούτω καθεξής παράγουν μυκοτοξίνες οι οποίες μπορεί να είναι επικίνδυνες εάν αγγίζονται, εισπνέονται ή καταναλώνονται. Άνθρωποι που έχουν αρρωστήσει από την έκθεση σε μούχλα έχουν καταθέσει επιτυχώς για ζημίες σε ορισμένες περιπτώσεις, υποστηρίζοντας ότι ο κατασκευαστής ή ο ιδιοκτήτης μιας κατασκευής δεν κατάφερε να την κατασκευάσει και να τη συντηρήσει σωστά, προσκαλώντας την εισβολή της μούχλας.
Οι τοξίνες που παράγονται από μύκητες ήταν επίσης γνωστές στον αρχαίο κόσμο. Το Ergot, ένας μύκητας που προσβάλλει δημητριακά, παράγει μια τοξίνη που προκαλεί μια ποικιλία πολύχρωμων συμπτωμάτων. Μερικοί άνθρωποι κατάποσαν ιστορικά το ergot σκόπιμα με στόχο να απολαύσουν τις ψυχοτρόπες επιδράσεις του, και κάποιοι άλλοι μύκητες καταναλώνονται στη σύγχρονη εποχή για τον ίδιο περίπου λόγο.
Τα συμπτώματα της έκθεσης στις μυκοτοξίνες ποικίλλουν σημαντικά, επειδή είναι τόσο διαφορετικά. Τα αποτελέσματα των μυκοτοξινών μπορεί επίσης να ποικίλουν ανάλογα με την ποσότητα και τη διάρκεια της έκθεσης. Πολλές μυκοτοξίνες επηρεάζουν το νευρικό σύστημα, προκαλώντας συμπτώματα όπως ζάλη, αδεξιότητα, θολή όραση και σύγχυση, αλλά αυτά τα συμπτώματα δεν εμφανίζονται σε όλες τις περιπτώσεις ή με όλες τις μυκοτοξίνες.