Podstawa kosztowa dla funduszy inwestycyjnych reprezentuje premię, jaką inwestor zapłacił za zakup akcji danego funduszu. Inwestorzy mogą obliczyć podstawę kosztową umorzenia sprzedaży funduszu powierniczego za pomocą metody księgowej zwanej metodą pierwsze weszło, pierwsze wyszło (FIFO). Alternatywnie, inwestorzy mogą zastosować określoną metodę identyfikacji lub metodę średniego kosztu, chociaż zasady obliczania podstawy kosztowej do celów sprawozdawczości podatkowej różnią się w zależności od kraju.
Wiele towarzystw funduszy wzajemnych wymaga od inwestorów płacenia prowizji, zwanych obciążeniami, za każdym razem, gdy akcje są kupowane lub sprzedawane. Opłaty uiszczane w momencie zakupu są określane jako obciążenia front-end iw większości krajów inwestorzy mogą dodać te obciążenia do podstawy kosztowej funduszy inwestycyjnych. Kiedy inwestor sprzedaje udział, inwestor odlicza koszt udziału i obciążenie od wartości umorzenia i zgłasza różnicę jako zysk z transakcji podlegający opodatkowaniu. Kursy akcji funduszy inwestycyjnych są ustalane po zamknięciu giełdy w danym dniu, a cena akcji zależy od wartości zamknięcia papierów wartościowych przechowywanych w ramach funduszu. W konsekwencji, jeśli inwestor kupi kilka akcji danego funduszu jednego dnia, wszystkie te akcje będą miały tę samą cenę i taką samą podstawę kosztową.
Kiedy inwestor kupuje kilka akcji danego funduszu w różnych okresach czasu, to każda z tych akcji ma inną podstawę kosztową. Jeśli inwestor następnie sprzedaje te akcje w regularnych odstępach czasu, zwykle musi obliczyć podstawę kosztu akcji przy użyciu metody FIFO. Zgodnie z FIFO zakłada się, że pierwsze akcje, które inwestor kupuje, są pierwszymi akcjami, które inwestor sprzedaje.
Specjalna metoda identyfikacji umożliwia inwestorom określenie akcji, które są umarzane w określonym momencie. Oznacza to, że inwestor może zdecydować się na sprzedaż akcji, które zostały nabyte po najwyższej cenie, tak aby zminimalizować zyski kapitałowe i podatki wynikające z umorzenia akcji. Metoda średniego kosztu polega na zsumowaniu całkowitego kosztu zakupu udziałów i opłat za doładowanie oraz podzieleniu tej sumy między liczbę udziałów, które posiada inwestor. Każda akcja ma wtedy taką samą podstawę kosztową, chociaż zyski kapitałowe z umorzenia akcji mogą się różnić, jeśli inwestor sprzeda akcje w różnych momentach.
Niektóre towarzystwa funduszy inwestycyjnych sprzedają tak zwane fundusze bez obciążenia, a inwestorzy nie muszą płacić obciążenia, aby kupić te akcje. Jednak w wielu przypadkach udziałowcy z akcjami bez obciążenia muszą płacić opłaty transakcyjne za zakup akcji, ale są to opłaty manipulacyjne, w przeciwieństwie do prowizji od sprzedaży i nie są uważane za część podstawy kosztowej funduszy inwestycyjnych. W związku z tym opłaty transakcyjne nie są doliczane do ceny zakupu przy obliczaniu podstawy kosztowej dla funduszy inwestycyjnych, chyba że inwestor może odpisać te opłaty jako odliczenia podatkowe.