Zanik hipokampa jest formą uszkodzenia mózgu, która wpływa zarówno na pamięć, jak i nawigację przestrzenną. Często wiąże się to ze stanami utraty pamięci, takimi jak demencja i choroba Alzheimera. Przyczyny obejmują ciężki uraz, niedotlenienie i zapalenie mózgu, a także mogą obejmować zarówno długotrwały stres, jak i zaburzenia neurologiczne, takie jak stwardnienie rozsiane, padaczka i schizofrenia. Chociaż leki na receptę mogą spowolnić atrofię, a terapia może pomóc w opanowaniu skutków, nie ma znanego lekarstwa na atrofię hipokampa.
Hipokamp jest przedłużeniem kory mózgowej i znajduje się w przyśrodkowym płacie skroniowym. Większość ekspertów zgadza się, że odgrywa ona znaczącą rolę zarówno w pamięci, jak i świadomości przestrzennej, choć szczegóły jej zaangażowania są szeroko dyskutowane. Wydaje się również, że odgrywa istotną rolę w pamięci węchowej. Atrofia to kurczenie się lub zmniejszanie się; atrofia hipokampu jest więc kurczeniem się hipokampa.
Brak tlenu jest główną przyczyną uszkodzeń mózgu, w tym tego typu atrofii. Kiedy dopływ tlenu do mózgu zostaje odcięty, komórki mózgowe zaczynają obumierać, a części mózgu zaczynają zanikać. Inną przyczyną jest uraz głowy, często spowodowany silnym uderzeniem lub uderzeniem lub warunkami, które powodują „chlupotanie” mózgu w obrębie czaszki. Wiadomo również, że niektóre choroby, takie jak zapalenie mózgu, uszkadzają hipokamp. Osoby, które doświadczają obustronnego uszkodzenia hipokampa, czyli uszkodzenia obu stron hipokampa, mogą nie być w stanie tworzyć nowych wspomnień.
Chociaż często wiadomo, że napady padaczkowe koncentrują się w hipokampie, toczy się debata, czy napady te powodują atrofię hipokampa, czy też atrofia powoduje drgawki. Istnieje również znany związek między kurczeniem się hipokampa a zespołem Cushinga i uważa się, że oba są związane z nadmiernym poziomem kortyzolu. Osoby cierpiące na schizofrenię często doświadczają atrofii tej części mózgu, chociaż związek przyczynowy, jeśli w ogóle, jest niejasny.
Na hipokamp może również wpływać długotrwały stres, a dokładniej steroidy często używane do kontrolowania długotrwałego stresu. Długotrwałe stosowanie takich leków może ograniczać aktywność istniejących neuronów w hipokampie, a także zapobiegać powstawaniu nowych. Ten rodzaj uszkodzeń jest często związany z zespołem stresu pourazowego i ciężką depresją.
Wczesne objawy atrofii hipokampa u ludzi mogą obejmować trudności w przypominaniu sobie niedawnej przeszłości i dezorientację. Może również oznaczać trudności w nawigacji przestrzennej, co generalnie oznacza tendencję do gubienia się, nawet w znajomym środowisku. U zwierząt atrofia jest często naznaczona zwiększoną, prawie udręczoną aktywnością. Funkcję hipokampa wykazuje obecność i częstotliwość aktywności elektrycznej, którą można zmierzyć za pomocą elektroencefalogramu i ocenić przez specjalistę.