Nietoperze są pożytecznymi zwierzętami, ale mogą powodować duże problemy, gdy wprowadzają się do domu. Choroba stanowi duże zagrożenie inwazją nietoperzy, w tym histoplazmozę związaną z oddychaniem ich odchodami, znanymi jako guano, oraz ryzyko wścieklizny spowodowanej obchodzeniem się z zarażonymi nietoperzami. Usuwanie i czyszczenie nietoperzy powinno być wykonywane przez eksperta. Istnieją sposoby, w jakie właściciele domów mogą zapobiec początkowej kolonizacji nietoperzy lub przyszłym inwazjom.
Mniej niż jeden procent populacji nietoperzy jest nosicielem wirusa wścieklizny. Należy unikać wszelkiego kontaktu z nietoperzami, ponieważ wściekłe nietoperze nie zawsze wykazują nietypowe zachowanie. Histoplazmoza to choroba płuc spowodowana wdychaniem grzyba obecnego w odchodach nietoperzy lub ptaków. Guano nietoperzy i mocz mogą również powodować uszkodzenia strukturalne domu. Nietoperz znaleziony w pomieszczeniu prawdopodobnie oznacza konieczność usunięcia nietoperza.
Właścicieli domów, którzy znajdą w domu nietoperza, zachęca się, aby nie dotykali go gołymi rękami. Grube skórzane rękawiczki ochronią przed ugryzieniami. Na nietoperza można delikatnie rzucić siatkę lub ręcznik, aby go złapać. Jeśli znajduje się na zasłonie lub innej pionowej powierzchni, na nietoperz można umieścić pudełko lub można umieścić pod nim płaską deskę lub kawałek tektury. Lokalny departament zdrowia lub kontrola zwierząt mogą pomóc w poddaniu nietoperza testom na wściekliznę.
Ponieważ wiele gatunków nietoperzy jest chronionych, eksterminacja na wielu obszarach jest nielegalna. Najlepszym sposobem na usunięcie nietoperzy jest wykluczenie i należy tego unikać między majem a sierpniem, kiedy najprawdopodobniej obecne są młode nietoperze niezdolne do latania. Ekspert najpierw dokładnie obejrzy konstrukcję, aby zobaczyć, gdzie nietoperze wchodzą i wychodzą. Nietoperze mogą przeciskać się przez otwory tak małe jak 1/2 cala (1.27 cm), więc inspekcja musi obejmować wszystkie szczyty, otwory wentylacyjne i nawisy na budynku.
Po zidentyfikowaniu dostępnych otworów można zainstalować klapy jednokierunkowe wykonane z tworzywa sztucznego lub siatki, które umożliwiają nietoperzom wyjście, ale nie ponowne wejście. Po zakończeniu wyjmowania nietoperza urządzenia można wyjąć, a otwory zamknąć. Można wtedy rozpocząć naprawę guana i naprawę wszelkich szkód wyrządzonych przez nietoperze. Ubezpieczenie może obejmować sprzątanie i proces wykluczenia, ponieważ zwierzęta nie są gryzoniami.
Regularna konserwacja konstrukcji w celu zidentyfikowania maleńkich dziur i szczelin, w które mogą wejść nietoperze, pomoże im zapobiec powrotowi. Otwory wentylacyjne szczytowe można zablokować siatką drucianą, a wszystkie pęknięcia należy uszczelnić masą uszczelniającą. Po udanym usunięciu nietoperzy, domek dla nietoperzy może zostać zainstalowany na podwórku, jeśli właściciele domów chcą zatrzymać zwierzęta w pobliżu ze względu na ich zdolności do zwalczania owadów.