Η ασφάλεια των οδοντικών σφραγισμάτων υδραργύρου, τα οποία είναι στην πραγματικότητα ένα κράμα μετάλλων, όπως ασήμι, κασσίτερος, ψευδάργυρος και χαλκός μαζί με περίπου 50% υδράργυρο, συζητείται συχνά. Υπάρχουν μελέτες που δείχνουν ότι η ποσότητα υδραργύρου στο σώμα ενός ατόμου που έχει οδοντικά σφραγίσματα υδραργύρου είναι σημαντικά υψηλότερη από τα επίπεδα υδραργύρου σε άτομα χωρίς αυτά τα σφραγίσματα. Ενώ ο υδράργυρος είναι γνωστό ότι είναι ένα τοξικό υλικό που μπορεί να προκαλέσει σοβαρά προβλήματα ψυχικής υγείας, δεν έχει υπάρξει καμία μελέτη που να αποδεικνύει με βεβαιότητα ότι τα οδοντικά σφραγίσματα από υδράργυρο αποτελούν απειλή για την υγεία ενός ατόμου.
Η Αμερικανική Οδοντιατρική Ένωση (ADA) συνεχίζει να χρησιμοποιεί οδοντικά σφραγίσματα υδραργύρου για πολλούς ασθενείς. Επισήμως, η θέση της ADA είναι ότι αυτά τα σφραγίσματα είναι ασφαλή για τους ασθενείς και ότι η ποσότητα υδραργύρου που απελευθερώνεται στην κυκλοφορία του αίματος δεν έχει καμία συνέπεια. Αυτός ο οργανισμός ζήτησε επίσης από τον Οργανισμό Τροφίμων και Φαρμάκων (FDA) να μην συμπεριλάβει μια προειδοποίηση προς τους ασθενείς που περιγράφουν τους πιθανούς κινδύνους του υδραργύρου όταν εξετάζουν εάν θα χρησιμοποιήσουν ή όχι αυτούς τους τύπους γεμίσματος.
Μελέτες που πραγματοποιήθηκαν τη δεκαετία του 2000 δείχνουν ότι τα οδοντικά σφραγίσματα υδραργύρου μπορούν να απελευθερώσουν υδράργυρο στο σώμα ενός ατόμου όταν αναπνέει και μασάει. Τα γεμίσματα μπορεί επίσης να αλλοιωθούν με την πάροδο του χρόνου και να σπάσουν πιο γρήγορα καθώς το κάνουν. Παρά αυτά τα ευρήματα, μελέτες δεν έχουν δείξει καμία σημαντική γνωστική διαφορά μεταξύ των ενηλίκων με οδοντικά σφραγίσματα υδραργύρου και εκείνων που δεν έχουν. Τα αποτελέσματα είναι τα ίδια και στα παιδιά, που κινδυνεύουν περισσότερο από δηλητηρίαση από υδράργυρο.
Η διαμάχη σχετικά με τα οδοντικά σφραγίσματα υδραργύρου έχει οδηγήσει πολλούς ανθρώπους να επιλέξουν σφραγίσματα από ρητίνη αντί από μέταλλο. Οι πρόσφατες εξελίξεις έχουν κάνει αυτά τα σφραγίσματα ισχυρότερα και πιο ανθεκτικά από ό,τι ήταν παλιά, αν και εξακολουθούν να διασπώνται πιο συχνά από τα οδοντικά σφραγίσματα υδραργύρου. Τα σφραγίσματα ρητίνης έχουν επίσης το πλεονέκτημα ότι έχουν το ίδιο χρώμα με το δόντι, γεγονός που τα καθιστά σχεδόν αόρατα. Επιπλέον, τα σφραγίσματα ρητίνης απαιτούν από τον οδοντίατρο να ανοίξει μια μικρότερη τρύπα στο δόντι όταν γεμίζει μια κοιλότητα.
Υπάρχουν ορισμένοι ασθενείς που ασχολούνται αρκετά με τα οδοντικά σφραγίσματα υδραργύρου που επέλεξαν να τα αφαιρέσουν. Αυτό δεν συνιστάται από την ADA γιατί μπορεί να οδηγήσει σε προβλήματα με το δόντι εάν το σφράγισμα δεν εξαχθεί σωστά. Τα άτομα που συνεχίζουν να ανησυχούν για τα οδοντικά σφραγίσματα με υδράργυρο μπορούν να επιλέξουν να έχουν τυχόν επόμενα σφραγίσματα από ρητίνη αντί για μεταλλικό αμάλγαμα, το οποίο είναι συνήθως διαθέσιμο στα περισσότερα οδοντιατρεία.