Kończyna fantomowa to uczucie, że brakująca kończyna lub narząd są nadal przyczepione do ciała. Osoba zwykle czuje, że kończyna porusza się normalnie, a nawet może gestykulować lub odczuwać ból. Zespół kończyny fantomowej występuje u większości osób, którym amputowano kończynę, chociaż ataki zwykle pojawiają się i znikają. Wiele osób z tym zespołem zgłasza ból w kończynie, że kończyna jest skarłowaciała i skręcona, lub jedno i drugie. W większości przypadków napady są najczęstsze zaraz po usunięciu kończyny, oka lub zęba, a wraz z upływem czasu stają się coraz rzadsze.
Objawy tego zespołu różnią się w zależności od osoby, zwykle w zależności od tego, jak i kiedy straciła część ciała. Jeśli ktoś rodzi się bez kończyn, zwykle odczuwa inne odczucia niż ktoś, kto jest sparaliżowany lub ma amputowaną kończynę. Ponadto ktoś, kto został amputowany w ciągu miesiąca, może mieć znacznie częstsze objawy zespołu kończyny fantomowej niż ktoś, kto został amputowany kilkadziesiąt lat temu. Jednak w niektórych przypadkach osoba rzadko lub nigdy w ogóle nie odczuwa bólu, chociaż nadal odczuwa przyczepioną wcześniej kończynę lub narząd.
Istnieją tylko teorie wyjaśniające, dlaczego pojawia się zespół kończyny fantomowej. Jedna z teorii głosi, że zakończenia nerwowe amputowanej lub brakującej kończyny wysyłają bezsensowne sygnały do mózgu, który staje się zdezorientowany i decyduje, że te sygnały są prawdopodobnie spowodowane bólem. Niestety ta teoria nie została udowodniona, a naukowcy wciąż badają przyczynę.
W przypadku kończyny fantomowej w grę może wchodzić wiele metod leczenia. Dość powszechne jest stosowanie leków, takich jak antydepresanty oraz stosowanie hipnozy i akupunktury. Kiedy pacjent odczuwa ból lub dyskomfort w kończynie fantomowej z powodu poczucia, że jest sparaliżowana lub w jakiejś niewygodnej pozycji, czasami stosuje się zabieg zwany lustrzanym pudełkiem. Chodzi o to, że mózg myśli, że kończyna fantomowa jest sparaliżowana lub w stanie niepełnosprawności, ponieważ może wizualnie rozpoznać, że się nie porusza lub że kończyna była w stanie negatywnym, gdy była jeszcze przyczepiona do ciała. Pudełko lustrzane pozwala pacjentowi widzieć dwie kończyny, gdy w rzeczywistości jest tylko jedna, ale porusza się obiema kończynami w wygodny sposób i otrzymuje wizualne sprzężenie zwrotne, łagodząc w ten sposób ból w kończynie fantomowej.