Przeglądarka genomu to interfejs sieciowy używany do przeglądania fizycznej mapy chromosomu. Ta mapa pokazuje, ile DNA oddziela dwa geny, mierzone w parach zasad. Ludzkie chromosomy mają wielkość od 50 milionów do ponad 250 milionów par zasad. Przeglądarka genomów pokazuje schematyczne reprezentacje całych chromosomów, a także „przybliżone” schematy pojedynczych genów, a nawet rzeczywistą sekwencję par zasad.
Przeglądarka genomu pozwala użytkownikowi przewijać chromosom i powiększać niektóre lokalizacje. Wiele przeglądarek genomu pozwala użytkownikowi na zbliżenie na poziomie oglądania rzeczywistej sekwencji DNA, chociaż prawdziwą użyteczność przeglądarki polega na możliwości oglądania genów w ich szerszym kontekście, a nie na oglądaniu sekwencji DNA na poziomie nukleotydów. Średnia wielkość genu to 3,000 par zasad, więc po powiększeniu na poziomie par zasad użytkownik zobaczy mniej niż cały gen. Największy ludzki gen, dystrofina, ma długość 2.4 miliona par zasad.
Oprócz przeglądania schematycznych reprezentacji genów, przeglądarki genomów mogą również pokazywać inne przydatne informacje. Może to obejmować część genu, która jest tłumaczona na białko, zwaną mRNA, oraz sekwencje DNA, które pełnią funkcje inne niż kodowanie białka. Przeglądarka genomu może również pokazać, które segmenty DNA zostały użyte w procesie sekwencjonowania genomu.
Wiele organizmów ma zsekwencjonowane genomy. Nie ma jednej przeglądarki, która byłaby standardowa w dziedzinie genomiki, więc przeglądarki genomów mogą się różnić w zależności od zsekwencjonowanych genomów. Przeglądarki genomu mają funkcję wyszukiwania genów lub sekwencji będących przedmiotem zainteresowania, umożliwiając użytkownikowi przeskakiwanie z jednego miejsca genomu do drugiego. Przewijanie chromosomu w celu dotarcia do interesującej lokalizacji nie byłoby wydajne z powodu bardzo dużego rozmiaru większości chromosomów.
Niektóre przeglądarki genomu mają narzędzia zwane sorterami genów. To narzędzie wyświetla tabelę powiązanych ze sobą genów. Związek może być jednym z kilku typów: homologia sekwencji, podobny profil ekspresji lub bliskość genomowa. Użytkownik wyszukuje gen za pomocą słowa lub frazy, wybiera rodzaj związku, który chciałby, a sortownik genów wyświetla wyniki wyszukiwania.