Co to jest wydobywanie sekwencji?

Sequence mining to rodzaj ustrukturyzowanego eksploracji danych, w którym baza danych i administrator szukają sekwencji lub trendów w danych. Ta eksploracja danych jest podzielona na dwa pola. Eksploracja sekwencji elementów jest zwykle wykorzystywana w marketingu, a eksploracja sekwencji ciągów jest wykorzystywana w badaniach biologicznych. Eksploracja sekwencji różni się od zwykłej eksploracji trendów, ponieważ dane są bardziej szczegółowe, co utrudnia budowanie efektywnej bazy danych projektantom baz danych i czasami może się nie udać, jeśli sekwencja różni się od zwykłej sekwencji.

W takim czy innym momencie wszystkie bazy danych są wykorzystywane do wydobywania danych. To wydobycie pomaga firmom i naukowcom znaleźć coś, czego potrzebują. Zwykle szukają jakiegoś trendu, ale jaki jest ten trend i jak szczegółowe są informacje, będzie zależeć od projektu bazy danych. W eksploracji sekwencji baza danych jest budowana tak, aby znaleźć bardzo specyficzne sekwencje, z niewielką lub żadną zmiennością. Jest to unikalna forma eksploracji danych strukturalnych, w której baza danych przeszukuje dane strukturalne pod kątem podobieństw.

Eksplorację sekwencji można podzielić na dwie kategorie. Eksploracja zestawów przedmiotów jest wykorzystywana w marketingu i biznesie do znajdowania określonych trendów w liczbie sprzedaży, typach produktów, lokowaniu produktu w sklepie i wykorzystaniu produktu. Liczby te są pobierane i stosowane w algorytmach marketingowych, aby pomóc w opracowaniu strategii projektu marketingowego i zwiększyć sprzedaż. Informacje o produkcie i sposobie jego działania są zazwyczaj pobierane z bazy danych, ale definiującym aspektem wyszukiwania sekwencji elementów jest to, że sekwencja jest pobierana z wielosymbolowych komórek bazy danych.

Eksploracja ciągów znaków jest przeciwieństwem eksploracji zestawów przedmiotów, ponieważ patrzy na każdy symbol indywidualnie, a nie jako klaster. W eksploracji łańcuchów baza danych może być ustawiona tak, aby znaleźć sekwencję ze źródła białka lub próbek genów. Pomaga to w porównywaniu wielu próbek genów, aby zobaczyć, czy są takie same, lub w rozbiciu dużych sekwencji i odnalezieniu zawartych w nich sekwencji. Korzystają z tego głównie zespoły badań biologicznych i medycznych.

Tworzenie bazy danych do eksploracji sekwencji może być trudne, ponieważ w przeciwieństwie do eksploracji trendów i innych ustrukturyzowanych eksploracji danych, sekwencje muszą dokładnie do siebie pasować. Prowadzi to również do problemu wydobywania sekwencji. Jeśli sekwencja jest inna, nie zostanie rozpoznana, co może utrudnić eksplorację zestawu przedmiotów. Wydobywanie strun zazwyczaj na tym korzysta, ponieważ najmniejsza różnica w próbce tkanki może sprawić, że organizm – lub cokolwiek bada zespół badawczy – będzie całkowicie odmienny od innych próbek.