Enzymy czosnku są naukowo znane jako enzymy alliinazy. Enzymy te przekształcają allinę, aminokwas w czosnku, w allicynę, fitochemikalia przytaczaną do obniżania ciśnienia krwi, obniżania poziomu cholesterolu i wzmacniania układu odpornościowego. Enzymy alliinazy stają się aktywne dopiero po uwolnieniu poprzez krojenie, żucie, siekanie lub miażdżenie czosnku. Uważany za najpotężniejszy składnik czosnku, enzymy czosnku są odpowiedzialne za nadanie warzywu charakterystycznego smaku i zapachu.
W przeważającej mierze obecne w oleju uwalnianym z czosnku, enzymy czosnku są uśpione w błonach komórek czosnku, dopóki czosnek nie zostanie zmanipulowany. Krojenie i miażdżenie niszczą błony, uwalniając enzymy. Ogrzewanie i gotowanie mają odwrotny skutek i mogą zabić większość enzymów w czosnku.
Oprócz całego, świeżego czosnku, enzymy czosnkowe dostępne są w czterech opcjach suplementacji: macerat z oleju czosnkowego, ekstrakt z czosnku, olejek eteryczny z czosnku z mielonego czosnku oraz proszek czosnkowy z mielonego, suszonego czosnku. Ta ostatnia jest powszechną przyprawą. Jednak kilka badań kwestionuje, że enzymy czosnku w suplementach są nieskuteczne. Wykazano, że tylko postać suplementu ekstraktu, stosowana miejscowo, przynosi pewne korzyści w badaniach laboratoryjnych.
W sferze zdrowia enzymy z czosnku są uważane za środki bakteriobójcze, zdolne do zabijania szkodliwych szczepów bakterii. Z tego powodu czosnek był stosowany w leczeniu angina i innych infekcji. Niektóre badania sugerują, że te enzymy mogą również zabijać wirusy; ta wiedza zachęca do używania czosnku przez pacjentów z ludzkim wirusem niedoboru odporności (HIV), opryszczką i innymi chorobami przenoszonymi drogą płciową.
Stosowanie enzymów czosnkowych w leczeniu co najmniej pięciu rodzajów raka pozostaje najczęstszym zastosowaniem zdrowotnym czosnku. Według danych medycznych wysokie spożycie czosnku może rzekomo zapobiegać lub odwracać raka okrężnicy i żołądka. Nowotwory złośliwe przełyku, piersi i trzustki również reagują na czosnek. Badania pokazują, że korzyści z enzymów nie pojawiają się w przypadku izolowanych enzymów, ale tylko wtedy, gdy alliinaza znajduje się w obecności innych fitochemikaliów w czosnku, takich jak alliina i allicyna. Z tego powodu wielu uważa, że najlepszym sposobem spożywania enzymów jest regularne spożywanie całego ząbka czosnku; zwolennicy zdrowia sugerują dawkę jednego goździka dziennie.
W środowisku medycznym powstało kilka teorii wyjaśniających wpływ enzymów czosnku na raka. Jedna z teorii głosi, że enzymy i inne substancje chemiczne zawarte w czosnku hamują aktywność czynników rakotwórczych. Inna teoria mówi, że czosnek może powstrzymać namnażanie się komórek rakowych i naprawić uszkodzone komórki, tak aby były zdrowe. Dodatkową teorią jest to, że spożycie czosnku powoduje śmierć tkanki nowotworowej.