Pomimo niepotwierdzonych twierdzeń, obecność prawdziwej alergii na czekoladę jest tak rzadka, że z medycznego punktu widzenia uważa się ją za praktycznie nieistniejącą. Ziarna kakaowca, główny składnik czekolady, zwykle nie są przyczyną objawów alergii pokarmowej po spożyciu czekolady. Każda niepożądana reakcja jest zwykle spowodowana przez inny składnik czekolady i nie jest konkretnie alergią na czekoladę.
Produkty czekoladowe najczęściej zawierają inne składniki, na które wiele osób może być uczulonych. Prawie wszystkie produkty czekoladowe zawierają składnik mleczny, taki jak mleko, a alergie na produkty mleczne są dość powszechne, szczególnie u małych dzieci. Dla osób, które nie tolerują laktozy, ale tolerują bardzo małe ilości mleka, alternatywą mogą być czekolady gorzko-słodkie, półsłodkie i ciemne. Te wyroby czekoladowe muszą mieć wyższe stężenie likieru czekoladowego, a zatem zawierać niższy procent mleka niż czekolada jasna lub mleczna. Na rynku dostępnych jest również kilka marek czekolady bezmlecznej dla osób z wyjątkowo wrażliwą nietolerancją laktozy.
Orzeszki ziemne i orzechy takie jak migdały, orzechy włoskie i pekan mogą być również źródłem reakcji alergicznej na produkty czekoladowe. Wiele batoników i innych wyrobów czekoladowych zawiera orzechy, ale nawet te, które nie zawierają orzechów, mogą okazać się problematyczne. Niektórzy producenci czekolady wytwarzają swoje słodycze na tych samych liniach produkcyjnych przy użyciu tych samych kadzi i maszyn, niezależnie od tego, czy w produkcie końcowym faktycznie występują orzechy. Dlatego nawet czekoladki, które nie zawierają orzechów, mogą nadal zawierać śladowe ilości orzechów lub olejów.
U osób wyjątkowo wrażliwych na orzechy, szczególnie tych z ciężką alergią na orzechy, nawet te maleńkie ślady produktów orzechowych mogą wywołać znaczącą reakcję. Osoby takie powinny zapoznać się z etykietą, a jeśli nie wspomniano o produkcji bez orzechów, należy skontaktować się z producentem. Istnieje kilku producentów czekolady bez orzechów, takich jak Nothin’ Nutty® i Vermont Nut-Free®.
Obecność kukurydzy w czekoladzie może powodować reakcję alergiczną u osób wrażliwych, co może być mylnie interpretowane jako alergia na czekoladę. Syrop kukurydziany o wysokiej zawartości fruktozy jest stosowany w wielu markach cukierków czekoladowych. Podobnie jak w przypadku orzechów, wielu producentów wytwarza czekoladki niezawierające kukurydzy na tych samych liniach produkcyjnych, co produkty, które ją zawierają. Zanieczyszczenie krzyżowe jest prawie niemożliwe do uniknięcia, a nawet niewielkie ilości kukurydzy mogą stanowić zagrożenie dla bardzo wrażliwych.
Innym możliwym winowajcą domniemanej alergii na czekoladę jest soja. Czekolada jest emulsją — mieszaniną dwóch płynów, które normalnie rozdzieliłyby się. Aby zapobiec rozdzielaniu się składników i utrzymać czekoladę w postaci stałej w temperaturze pokojowej, zazwyczaj dodaje się emulgator. Najpopularniejszym emulgatorem stosowanym w produktach czekoladowych jest lecytyna sojowa. Dodatek ten może być problematyczny dla osób z alergią na soję.
Jagody są popularnymi wypełniaczami do czekoladek w pudełkach, a także są jednym z bardziej alergizujących pokarmów. Osoby z alergią na jagody powinny unikać asortymentów czekoladowych, aby zminimalizować możliwą ekspozycję. Kofeina może również stanowić problem dla osób wrażliwych na tę substancję chemiczną. Chociaż obecna w czekoladzie w stosunkowo niewielkich ilościach, pomimo powszechnego przekonania, nadal może być w niej wystarczająca ilość kofeiny, która powoduje problemy u osób z dużą alergią. Należy pamiętać, że im ciemniejsza czekolada, tym wyższa zawartość kofeiny.
Osoby z alergią na pszenicę lub gluten, na przykład z celiakią, powinny zwrócić szczególną uwagę na etykietę przed spożyciem jakiegokolwiek produktu czekoladowego. Czekoladki z nadzieniem kremowym często wykorzystują skrobię pszenną lub mąkę jako spoiwo. Na rynku dostępne są czekoladki bezglutenowe takich firm jak Endangered Species Chocolate.
W bardzo rzadkich przypadkach spożywanie produktów czekoladowych może powodować objawy alergiczne u osób przyjmujących lek na receptę Prozac® lub inne inhibitory wychwytu zwrotnego serotoniny (SSRI). Czekolada może powodować uwalnianie niektórych neuroprzekaźników, w tym serotoniny. Prozac® i inne SSRI również wpływają na poziom serotoniny w mózgu. W połączeniu z czekoladą może to powodować interakcję z lekami.
Alergie pokarmowe mogą pojawić się w dowolnym momencie. W przypadku podejrzenia alergii na czekoladę lub innego rodzaju alergii pokarmowej należy skonsultować się z lekarzem. Jeśli objawy są poważne, w tym nagła wysypka, przyspieszony puls lub trudności w oddychaniu, należy zgłosić się do pogotowia ratunkowego. Lekarz prowadzący lub alergolog powinien dokładnie wiedzieć, jaki produkt został spożyty i czy dotyczy to leków na receptę lub bez recepty.