W czystej postaci w quinoa nie ma glutenu. W produktach z komosy ryżowej może być jednak gluten. Osoby z nadwrażliwością na gluten i bez niej mogą nadal wykazywać negatywne reakcje na nasiona, co może, ale nie musi, zależeć od sposobu ich przygotowania. Mimo to dla wielu osób zastąpienie tradycyjnej żywności zawierającej gluten komosą ryżową jest dobrą alternatywą, zwłaszcza jeśli ta wymiana odbywa się w rozsądnym tempie.
Częściowo dlatego, że w komosie ryżowej nie ma glutenu, jest on stosowany w wielu produktach spożywczych dla osób z alergią lub wrażliwością na gluten. Konsumenci muszą zachować ostrożność przy zakupie tych produktów, ponieważ obecnie na rynku dostępnych jest wiele produktów spożywczych, które zawierają nasiona, ale nie są bezglutenowe. Ludzie powinni sprawdzić opakowanie, aby ustalić, czy produkt został oznaczony jako niezawierający glutenu. Osoby ze skrajną alergią powinny również przeczytać o wytwarzaniu produktów, aby mieć pewność, że firmy nie używają sprzętu, który ma kontakt z glutenem.
Nawet po dokładnym sprawdzeniu, aby upewnić się, że nie został skażony glutenem, niektórzy ludzie mogą nadal reagować na komosę ryżową. Zgłoszenia działań niepożądanych obejmują wysypkę, skrajne rozstrój żołądka i uczucie omdlenia. Rozstrój żołądka może wystąpić sporadycznie, jeśli ludzie nie przygotują odpowiednio nasion. Pokryta jest gorzką powłoką, którą należy dokładnie zmyć przed gotowaniem. Jeśli zbyt dużo tej powłoki pozostanie na skórze, ludzie mogą rozwinąć rozstrój żołądka, nawet jeśli w komosie ryżowej nie ma glutenu.
Wiele osób jest już świadomych tych potencjalnych pułapek i kupuje wraz z nimi umytą komosę ryżową lub żywność bezglutenową. Niektórzy nadal mogą stwierdzić, że reagują negatywnie na komosę ryżową. Pod pewnymi względami trudno się temu dziwić, ponieważ większość produktów spożywczych powoduje u niektórych nieprzyjemne skutki uboczne. Ponieważ nasiona są niedawnym wprowadzeniem do wielu zachodnich diet, jest zbyt wcześnie, aby powiedzieć, jak często te reakcje będą się pojawiać i jaki procent populacji może to dotyczyć. Działania niepożądane z pewnością nie ograniczają się do osób z nietolerancją glutenu i wystąpiły u wielu osób, które nie zgłaszały wcześniejszych alergii pokarmowych.
Ponieważ w komosie ryżowej nie ma glutenu, biorąc pod uwagę jej wysoce włóknisty charakter, możliwe jest inne wyjaśnienie rozstroju żołądka po zjedzeniu. Jeśli ludzie nagle przestawią się z bardziej kleistych ziaren na komosę ryżową, mogą spożywać więcej błonnika niż zwykle. Czasami może to spowodować bardzo szybką pracę przewodu pokarmowego.
Szybkie zmiany w diecie mogą powodować wzdęcia, gazy i biegunkę, które mogą być mylnie interpretowane jako nadwrażliwość na gluten lub alergia. Aby uniknąć tej reakcji, ludzie powinni zacząć spożywać błonnik powoli, stopniowo zwiększając ilość pokarmów włóknistych, w miarę jak ich ciała budują większą tolerancję. Przeciętny zjadacz o niskiej zawartości błonnika, który nie może się oprzeć zjedzeniu stosu babeczek z komosy ryżowej, z perspektywy czasu może żałować tego wyboru.