Podczas gdy mnóstwo informacji na temat permakultury można znaleźć w Internecie lub w książkach, certyfikacja permakultury jest wymagana dla tych, którzy chcą używać chronionego prawem autorskim terminu „permakultura” w celach zawodowych. Certyfikacja permakultury jest przyznawana po pomyślnym ukończeniu kursu projektowania permakultury. Kursy projektowania oparte są na naukach współtwórców permakultury, Billa Mollisona i Davida Holmgrena, i są oferowane w wielu lokalizacjach na całym świecie. Kurs trwa zwykle około dwóch tygodni, w zależności od harmonogramu.
Pomimo pewnych różnic w organizacji i treści, kurs projektowania permakultury powinien opierać się na koncepcjach i zasadach przedstawionych po raz pierwszy przez Mollisona i Holmgrena. Wspólny zestaw zasad stanowi podstawę projektowania permakultury. Trzy najpowszechniej uznawane zasady etyczne są wyrażone skrótowo jako „troska o ziemię”, „troska o ludzi” i „sprawiedliwy udział”. Oprócz tych zasad etycznych, permakultura ma 12 zasad projektowania. Powszechnie używany obraz „kwiatu permakultury” pokazuje, jak wszystkie te zasady, reprezentowane jako serce kwiatu, są stosowane do zestawu siedmiu domen reprezentowanych przez płatki.
Zasady i domeny permakultury są zwykle pierwszym przedmiotem poruszanym na kursie projektowania permakultury. Późniejsze części kursu koncentrują się na zastosowaniu projektowania permakultury w siedmiu domenach. Kursy zazwyczaj obejmują następujące szerokie obszary: zrozumienie wzorców przyrodniczych i kulturowych; zrozumienie krajobrazów i stref klimatycznych; zarządzanie i ochrona zasobów; planowanie i projektowanie rolnictwa; planowanie i projektowanie środowiska zabudowanego; oraz ekonomia i marketing. Każdy z tych obszarów obejmuje szereg bardziej szczegółowych tematów. Zarządzanie zasobami i ich ochrona może na przykład obejmować między innymi energię odnawialną, oszczędzanie energii, pozyskiwanie wody i gospodarkę odpadami.
Oprócz tradycyjnej nauki w klasie, kursy projektowania w celu certyfikacji permakultury mają zazwyczaj charakter praktycznych szkoleń. Uczniowie mogą zastosować to, czego się nauczyli, pracując z roślinami lub zwierzętami na farmie lub pomagając w budowie domu zaprojektowanego w sposób zrównoważony w społeczności permakulturowej. Ukończenie jednego lub więcej projektów projektowych jest również powszechnym wymogiem certyfikacji permakultury.
Chociaż projektowanie permakultury powstało w Australii w latach 1970., certyfikowanych instruktorów i kursy projektowania można znaleźć na całym świecie. Niektórzy instruktorzy wyrazili zaniepokojenie, że standardy dotyczące treści i dogłębnego uczenia się ustalone przez Mollisona i Holmgrena zostały osłabione przez szybko rosnącą liczbę certyfikowanych instruktorów i kursów projektowania. Australijski Instytut Permakultury i jego siostrzana organizacja, Instytut Permakultury w Santa Fe w Nowym Meksyku, pracują nad zapewnieniem standardowego programu nauczania na kursach dających certyfikat permakultury.