Pomimo ogromnej liczby różnych mięśni, które łączą i poruszają strukturę szkieletu, anatomia mięśni szkieletowych jest zasadniczo taka sama w całym ciele. Mięśnie szkieletowe składają się z długich wielojądrowych komórek o cylindrycznym kształcie. Mięśnie są prawie zawsze przyczepione bezpośrednio do kości iw przeciwieństwie do pozostałych dwóch typów mięśni, sercowego i gładkiego, są pod dobrowolną kontrolą. Mięśnie szkieletowe mają wiele warstw i błon, które chronią i dzielą ich różne składniki. Komórki wielojądrowe można również nazwać włóknami, które grupują się w wiązki w zależności od świadomego działania, które kontrolują.
Pierwsza warstwa mięśni szkieletowych to cienka, elastyczna błona zwana sarkolemmą, która pokrywa poszczególne komórki. Główną funkcją sarkolemy jest utrzymywanie wszystkich różnych składników komórkowych w stanie nienaruszonym, podobnie jak błona komórkowa w innych komórkach ciała. W sarkolemmie płyn komórki mięśniowej lub sarkoplazma zawiera pl, miofibryl. Każde pojedyncze włókno zawiera wiele miofibryli, czyli nici białkowych biegnących przez całą długość włókna mięśniowego. Struktury te leżą obok siebie i są odpowiedzialne za wydłużanie i kurczenie mięśni na sygnał ośrodkowego układu nerwowego (OUN).
Miofibryle można dalej rozcinać na inny składnik, który jest bardziej bezpośrednio zaangażowany w kurczenie i wydłużanie włókna, sarkomer. Sarkomery działają jak maleńkie łańcuchy tkanki kurczliwej, które są ułożone od końca do końca w całej miofibryli. Na poziomie mikroskopowym miofibryl składa się z jeszcze cieńszej nici białka zwanego miofilamentem. Białka miofilamentowe składają się z ciemnych pasm lub pasm anizotropowych (A) i jasnych pasm lub pasm izotropowych (I); kontrastujące kolorowe białka nadają mięśniom szkieletowym prążkowany wygląd. Pasma A i I miofilamentu są również odpowiedzialne za metabolizm adenozynotrójfosforanu (ATP), który inicjuje skurcze mięśni.
Na poziomie makroskopowym mięśnie szkieletowe składają się z różnych warstw. Najbardziej zewnętrzna część nazywana jest epimysium i chroni mięśnie szkieletowe przed szkodliwym tarciem, które może wystąpić podczas poruszania się o inne mięśnie i kości. Epimysium jest szczególnie ważnym elementem anatomii mięśni szkieletowych, ponieważ wraz z innymi tkankami łącznymi tworzy ścięgno mięśniowe. Ścięgno mięśniowe to mocna, włóknista „lina”, która zapobiega ześlizgiwaniu się mięśni z punktów mocowania na kościach.