Potencjalny brak przejrzystości stanowi ryzyko w instytucjach finansowych. Większość światowych rynków kapitałowych w pewnym momencie przechodzi przez kanały instytucji finansowych, w tym banków inwestycyjnych i firm zarządzających pieniędzmi, takich jak fundusze hedgingowe i fundusze inwestycyjne. Większa regulacja w niektórych sektorach usług finansowych zmniejsza poziom ryzyka, na które narażone są banki i rynki. Jeśli bank jest tak duży i tak wpływowy, że jego upadek miałby wpływ na gospodarkę, ryzyko w tego typu instytucjach finansowych jest ogromne. Potencjalne udostępnianie poufnych informacji w niewłaściwy sposób to kolejny czynnik ryzyka związany z firmami finansowymi.
Instytucje finansowe tworzą wiele wyrafinowanych instrumentów, które są codziennie kupowane i sprzedawane na rynkach. Papiery wartościowe, takie jak kredytowe instrumenty pochodne, są często przedmiotem obrotu w celu ochrony innych ekspozycji i zarabiania pieniędzy dla samego banku oprócz klientów. Biorąc pod uwagę, że bank może zainwestować pieniądze z własnego bilansu w celu zwiększenia zysków generowanych w firmie, ryzyko w instytucjach finansowych staje się większe ze względu na możliwość złych transakcji lub nieoczekiwanych strat. Te niedobory mogą wywołać spadki przychodów, co staje się widoczne w bilansie — odzwierciedleniem kondycji finansowej instytucji.
Inne ryzyko w instytucjach finansowych wiąże się z możliwością nakładania się w firmie. Zwłaszcza niektóre banki są tak duże, że pełnią różne funkcje, od analizy finansowej po działalność bankowości inwestycyjnej. Linie etyczne mogą łatwo ulec zatarciu, gdy firma odniesie korzyści z klientem, na przykład na podstawie sposobu, w jaki inwestorzy publiczni traktują akcje. Praktyki regulacyjne i branżowe, takie jak chiński mur, ewoluowały, aby spowodować oddzielenie tych ról, tak aby zmniejszyć tendencję lub prawdopodobieństwo wystąpienia jakichkolwiek nieprawidłowości.
Istnieją sposoby dla instytucji finansowych na ograniczanie ryzyka dla firmy i całej gospodarki. Na przykład niektóre instytucje finansowe są tak duże i przeprowadzają tak dużą liczbę transakcji finansowych, że każde bankructwo lub inna awaria może stanowić zagrożenie systemowe dla gospodarki. Przepisy regionalne, które wzywają do przejrzystości rodzajów transakcji przeprowadzanych przez banki i inne firmy finansowe oraz stosowanych strategii, promują mniejszy stopień ryzyka. Ponadto im częściej kierownictwo najwyższego szczebla, takie jak dyrektor finansowy, oraz specjaliści ds. ryzyka, tacy jak dyrektor ds. zgodności, komunikują i koordynują cele, tym bardziej prawdopodobne jest, że ryzyko w instytucjach finansowych będzie spadać.