Płyty główne komputerów często nie działają nieprawidłowo podczas normalnego użytkowania, ale kiedy tak się dzieje, może być trudno zrozumieć, dlaczego. Po części dzieje się tak dlatego, że często nie ma widocznych uszkodzeń fizycznych. Najczęstsze przyczyny smażonej płyty głównej mogą obejmować wstrząsy statyczne, przepięcia, nadmierne ciepło, awarie części lub ogólne niewłaściwą obsługę. Przyczyną awarii może być również wiele innych, bardziej skomplikowanych problemów technicznych.
Elektryczność statyczna jest prawdopodobnie najczęstszą przyczyną smażenia płyty głównej. Podczas obsługi sprzętu komputerowego, takiego jak płyta główna, ważne jest, aby dana osoba rozładowała elektryczność statyczną, która została nagromadzona w ciele. Ładunek ten, jeśli zostanie przeniesiony na płytę główną, może spowodować zwarcie jej elementów, czyniąc ją bezużyteczną. Osoba może rozładować ładunki elektrostatyczne, dotykając kawałka metalu przed rozpoczęciem pracy przy komputerze. Pomocna jest również praca na macie antystatycznej lub twardej podłodze; podczas korzystania z komputera z dywanikiem pod spodem można gromadzić ładunki elektrostatyczne i nie jest to zalecane.
Skoki napięcia i uszkodzone zasilacze to także powody, dla których płyta główna jest smażona. Przepięcia mogą wystąpić podczas burzy, a komputer, który nie jest podłączony do urządzenia przeciwprzepięciowego, może ulec uszkodzeniu. Listwa przeciwprzepięciowa pomoże chronić części komputera przed wstrząsami. Nawet jeśli płyta główna nie uszkodzi się podczas przepięcia, uszkodzone zasilacze mogą po pewnym czasie spowodować jej awarię. Zasilacze, które nie wytwarzają zalecanej mocy, mogą również powodować problemy z płytą główną.
Przegrzanie, kurz i brud są również częstymi przyczynami awarii płyty głównej. Jeśli tablica została umieszczona w obudowie komputera, która jest bardzo mała lub słabo wentylowana, może się łatwo przegrzać. Jeśli obudowa nie została wyposażona w prawidłowo działający wentylator, nie ma możliwości odprowadzenia nadmiaru ciepła z dala od części. Jeśli wentylator jest zatkany brudem i rzadko czyszczony, nie może prawidłowo schłodzić systemu. Brud może również gromadzić się wewnątrz obudowy komputera i powodować problemy, przez co bardzo ważne jest regularne czyszczenie.
Tańsze płyty główne mogą mieć tendencję do szybszej awarii niż inne, ponieważ wadliwe kondensatory mogą powodować problemy z tymi, które nie są dobrze wykonane. Tego typu uszkodzenia mogą być faktycznie widoczne, np. gdy kondensatory przeciekają lub wybrzuszają się. Niewłaściwa obsługa może również powodować problemy z płytą główną. Tablica zawiera wiele małych, delikatnych części, a trzymanie jej w niewłaściwy sposób może wygiąć lub złamać te części. Płyta główna powinna być zawsze przenoszona i trzymana za krawędzie, aby uniknąć kontaktu z jej elementami.