Gotowanie kuskusu może być prostym procesem, w którym warto pamiętać o kilku wskazówkach. Wielu kucharzy zgadza się, że gotowanie kuskusu na parze jest lepsze niż gotowanie go w wodzie jak ryż. Wiedza o tym, jaki rodzaj kuskusu jest gotowany, to kolejny ważny element, ponieważ niektóre odmiany – takie jak kuskus izraelski – mają nieco inne instrukcje gotowania. Ważne jest również, aby zrozumieć, że kuskus ma bardzo słaby smak, więc wiedza o tym, jak i z czym będzie spożywany, może dyktować dodatkowe składniki, które można dodać.
Gotowanie na parze było pierwszym sposobem gotowania kuskusu i nadal jest to najskuteczniejszy sposób gotowania kuskusu. Proces gotowania na parze zajmuje więcej czasu niż inne metody, ale daje kuskus o bardziej puszystej konsystencji i większej objętości. Płyn do gotowania używany podczas gotowania na parze nie musi być wodą. Zastąpienie wody bulionem lub mieszanką wody i wina może nadać zbożom głęboki smak, który może uzupełnić główne danie.
Rodzaj kuskusu może mieć wpływ na sposób i czas gotowania. Główną różnicą jest wielkość ziarna. Małe ziarna, takie jak w marokańskim kuskusie, można dość szybko gotować na parze. Gotowanie wielkoziarnistego kuskusu, takiego jak odmiana libańska, może wymagać techniki bardziej zbliżonej do gotowania risotto. Wszystkie odmiany można umieścić bezpośrednio w płynie i ugotować, niezależnie od wielkości, ale większe ziarna będą długo parować i mogą przybrać postać pasty.
Smak kuskusu po ugotowaniu jest subtelny. Może to być zaletą, ponieważ podczas gotowania kuskusu można dodawać inne składniki, aby wpłynąć na ostateczny smak. Popularne dodatki to orzeszki pinii, masło i świeżo posiekane zioła. Innym sposobem na dodanie smaku jest dodanie przypraw, warzyw i innych potraw do gotującego się na parze płynu. Dodanie do płynu cebuli, laski cynamonu lub nawet kawałka mięsa nada mu bogatszy smak.
Gotując kuskus bezpośrednio w wodzie lub bulionie, najlepiej traktować go jak ryż. Dotyczy to szczególnie kuskusu błyskawicznego. Należy dodać wystarczającą ilość wrzącego płynu, aby przykryć ziarna; woda powinna być ponownie zagotowana i przy wyłączonym ogrzewaniu lub włączonym na najniższym ustawieniu, przykryty garnek należy pozostawić na kuchence, aż będzie gotowy. O ile ziarna nie są duże, metody takie jak dodawanie płynu i ciągłe mieszanie aż do ugotowania kuskusu spowodują, że ziarna będą lepkie i ciężkie, a nie lekkie i puszyste. Dodaniu zbyt dużej ilości płynu można zaradzić, spuszczając nadmiar z patelni, a następnie powoli podgrzewając kuskus i mieszając, aż wyschnie do akceptowalnej konsystencji.