Najlepsze wskazówki dotyczące pieczenia chleba pełnoziarnistego to namoczenie ziaren przed dodaniem ich do ciasta, dwukrotne wyrośnięcie ciasta przed pieczeniem, posmarowanie chleba masłem przed pieczeniem i unikanie zbytniego wysuszenia ciasta. Te wskazówki pomagają sprawić, aby chleb rósł tak bardzo, jak to możliwe i nie stwardniał zbyt mocno podczas pieczenia. Ziarna muszą być namoczone, aby je zmiękczyć i ułatwić jedzenie. Posmarowanie chleba roztopionym masłem przed pieczeniem pomaga zapobiec stwardnieniu skórki po ugotowaniu.
Ziarna zawarte w chlebie pełnoziarnistym należy namoczyć przed dodaniem ich do masy ciasta. Podczas pieczenia chleba pełnoziarnistego nienamoczone ziarna mogą być twarde i trudne do spożycia. Piekarze powinni umieścić ziarna w szklance wody na noc przed pieczeniem. Powinni liczyć się z tym, że ziarna pęcznieją podczas procesu namaczania. Wodę należy dodać do ciasta wraz z ziarnami.
Dwukrotne wyrośnięcie ciasta to dobra wskazówka do pieczenia chleba pełnoziarnistego. Wielu piekarzy pozostawia chleb tylko raz, aby wyrósł, zanim zacznie się wybijać i piecze. Zmniejsza to ilość otworów powietrznych w gotowym bochenku i sprawia, że chleb jest gęstszy. Chleb należy pozostawić do wyrośnięcia dwukrotnie, aby zwiększyć ilość otworów wentylacyjnych w bochenku i ułatwić jego spożywanie. Piekarze powinni przykryć ciasto wilgotnym ręcznikiem, aby zapobiec przedostawaniu się powietrza do ciasta.
Ciasto mokre jest lepsze niż ciasto suche podczas pieczenia chleba pełnoziarnistego. Idealnie ciasto powinno lekko przywierać do palców piekarza podczas wyrabiania, ale nie pozostawiać resztek. Wielu piekarzy-amatorów ma trudności z uzyskaniem właściwej konsystencji ciasta. Jeśli piekarz nie jest pewien, powinien pozostawić chleb nieco zbyt mokry, a nie zbyt suchy. Suche ciasto często staje się zbyt twarde podczas gotowania, a powstały chleb jest trudniejszy do zjedzenia.
Posmarowanie wierzchu bochenka roztopionym masłem to kolejna dobra wskazówka podczas pieczenia chleba pełnoziarnistego. Dzięki temu wierzchnia skórka nie stanie się zbyt twarda i trudna do spożycia. Piekarze powinni rozpuścić trochę masła, a następnie lekko posmarować nim wierzch bochenka, zanim trafi on do piekarnika. Każdy bochenek należy posmarować około dwiema łyżkami roztopionego masła lub margaryny. Po upieczeniu chleb należy pozostawić do ostygnięcia.