Jednym z głównych objawów nietolerancji glutenu u dzieci jest ból brzucha, często skutkujący zmniejszeniem apetytu i wymiotami. Takie objawy często powodują brak wzrostu we właściwym tempie. Ponadto fizyczny dyskomfort może prowadzić do pewnych problemów behawioralnych, takich jak drażliwość, zmęczenie i depresja. Objawy nietolerancji glutenu u dzieci zwykle nie są obserwowane, dopóki nie osiągną odpowiedniego wieku, aby rozpocząć spożywanie pokarmów zawierających to białko, takich jak chleb, miękki ser, płatki zbożowe, ciasta, ciastka, makarony i przetworzone mięso, żeby wymienić tylko kilka produktów.
Wrażliwość na gluten, który jest białkiem znajdującym się w pszenicy, jęczmieniu, żyto i owsie, nie zawsze jest rozpoznawana przez dzieci, ponieważ rodzice mogą nie zauważyć objawów. Jednym z podstawowych wskaźników nietolerancji glutenu u dzieci jest dyskomfort w przewodzie pokarmowym. Zmniejszony apetyt to kolejna oznaka, prawdopodobnie z powodu występowania skurczów i bólu brzucha, co utrudnia nawet myślenie o jedzeniu. Wymioty często występują nawet wtedy, gdy dziecko faktycznie je. Biegunka, gazy i zaparcia to inne problemy żołądkowe, które często pojawiają się u dzieci z nietolerancją glutenu. W rzeczywistości zgaga, zespół jelita drażliwego, refluks żołądkowy i krwawienie z odbytu mogą wystąpić u dzieci z nietolerancją glutenu, dlatego mądrze jest unikać pokarmów, które powodują problemy.
Ten dyskomfort w jamie brzusznej często prowadzi do utraty wagi lub przynajmniej niezdolności do prawidłowego przybierania na wadze. Opuchnięty żołądek w połączeniu z nienormalnie cienkimi nogami i ramionami może często być oznaką nietolerancji glutenu u dzieci. Dzieje się tak, ponieważ nie mogą prawidłowo wchłaniać składników odżywczych i zwykle czują się chore tak często, że nie jedzą tak dużo lub tak często, jak powinny. U dzieci z nietolerancją glutenu dojrzewanie jest często opóźnione o lata, ponieważ nie są one w stanie jeść dużo w latach, w których powinny rosnąć najbardziej.
Tak duży dyskomfort fizyczny i niezdolność do wzrostu może często prowadzić do zmian behawioralnych u dotkniętych chorobą dzieci. Drażliwość, zmęczenie, wahania nastroju i depresja często występują u dzieci, które nie są w stanie prawidłowo przyswajać składników odżywczych z powodu nietolerancji glutenu. Bóle głowy, anemia i bóle stawów zwykle nie poprawiają nastroju. Ponadto dzieci z tym problemem zazwyczaj cierpią na inne drobne, ale bolesne problemy zdrowotne, takie jak owrzodzenie jamy ustnej, egzema na skórze i problemy z zębami. Takich objawów należy się spodziewać i zwykle przyczyniają się one do zmian behawioralnych, dopóki u dziecka nie zostanie zdiagnozowana nietolerancja glutenu, a ostatecznie wyeliminuje się żywność, która powoduje problem.