Głównym problemem zdrowotnym związanym z guano nietoperzy jest histoplazmoza. Ta choroba przenoszona drogą powietrzną ma swój początek w grzybie żyjącym w odchodach nietoperzy. Może wpływać na układ oddechowy każdego człowieka, który wdycha powietrze, które zostało na niego wystawione. Organizm jest zazwyczaj zdolny do walki z tą chorobą, jednak osoby z osłabionym układem odpornościowym mogą wymagać leczenia.
Nietoperze często gnieżdżą się na strychach i otwierają krokwie domów i stodół. Śpią w ciągu dnia, polują w nocy, a po kilku sezonach mogą tworzyć rozległe gniazda, łącząc się w pary i rodząc młode. Guano nietoperzy, które zostawiają, zarówno w górnej części domu, jak i na ziemi na zewnątrz, jest bardzo toksyczne dla ludzi, jeśli zostaną zakłócone.
Histoplazmoza może żyć na powierzchni guana nietoperzy lub w glebie wystawionej na działanie odchodów. Kiedy guano jest w jakikolwiek sposób podburzane, grzyb szybko unosi się w powietrzu. Może krążyć w powietrzu do oddychania w domu lub budynku i infekować płuca każdej osoby, która go wdycha.
Choroba zwykle wymaga okresu około dziesięciu dni, aby wykiełkować i zacząć wykazywać objawy. Chorzy często skarżą się na gorączkę, bóle w klatce piersiowej, kaszel, ból głowy i utratę apetytu. Układ odpornościowy organizmu jest na ogół zdolny do zwalczenia choroby i pełnego wyzdrowienia w ciągu kilku tygodni. Osoby z osłabionym układem odpornościowym, takie jak osoby już chore na inną chorobę lub zakażone AIDS, mogą wymagać leczenia, w tym leków i hospitalizacji.
Wiele krajów, w tym USA, chroni nietoperze jako gatunek zagrożony i nie pozwala na ich eksterminację podczas procesu usuwania. Właściciele domów mogą chcieć skontaktować się z profesjonalnym tępicielem, który może całkowicie usunąć infestację bez zabijania zwierząt. Po wykonaniu tych czynności należy natychmiast zakleić wszelkie pozostałe otwory na strych lub krokwie domu, aby uniemożliwić zwierzętom powrót. Niektóre z tych usług pobierają również opłatę za wywóz odchodów zwierząt.
Guno nietoperzy jest toksyczne tylko wtedy, gdy zostanie zakłócone, i samoczynnie rozproszy się w powietrzu, jeśli pozostanie nietknięte po dwóch do trzech latach. Jeśli inwazja miała miejsce w części domu, która może być odgrodzona od mieszkańców, lub w rzadko używanej oficynie, wówczas korzystne może być w ogóle nie usuwać odchodów. Większość przypadków zachorowań spowodowanych narażeniem na tego typu odpady występuje po oczyszczeniu i usunięciu gniazda lub gleby w pobliżu gniazda. Jeśli właściciel domu woli posprzątać okolicę, powinien nosić maskę na twarz, która może filtrować cząsteczki o wielkości nawet jednego milimikrona. Powinien użyć odkurzacza z wysokowydajnym filtrem powietrza, aby usunąć odpady i natychmiast je wyrzucić do szczelnego worka na śmieci.