Infekcje wywołane przez wirusa brodawczaka ludzkiego, znanego również jako HPV, często powodują nieprawidłowe rozmazy. Choroby takie jak opryszczka i rzęsistkowica również mogą mieć taki efekt. Inne powody to powszechne nawyki, takie jak stosunek seksualny i używanie tamponów.
Jedną z najczęstszych przyczyn nieprawidłowego wymazu cytologicznego jest zakażenie HPV. Ten wirus, który może być przenoszony przez kontakt, w pewnym momencie życia zaraża wiele kobiet. Wiele kobiet nawet nie zdaje sobie sprawy, że ma wirusa, ponieważ w większości przypadków jest on zarażony, nie powoduje żadnych objawów i ostatecznie sam znika. Wirus może jednak wpływać na wymaz cytologiczny, ponieważ może powodować zmiany w komórkach szyjki macicy kobiety. W niektórych przypadkach nieprawidłowe komórki są leczone, ale nie zawsze jest to konieczne.
Niektóre choroby przenoszone drogą płciową (STD) mogą również powodować nieprawidłowy wymaz cytologiczny. Jednym z przykładów jest rzęsistkowica, która może powodować nieprawidłowe formacje przypominające halo w komórkach szyjki macicy. W przeciwieństwie do niektórych innych chorób przenoszonych drogą płciową, rzęsistkowica wydaje się wskazywać, że dana osoba jest zarażona. Należą do nich pienista, swędząca wydzielina, która może być żółtawa lub szaro-zielona oraz ból podczas oddawania moczu. Takie infekcje są powszechne i uleczalne.
Inną chorobą przenoszoną drogą płciową, która może powodować nieprawidłowy wymaz cytologiczny, jest opryszczka. Ten wirus nie ma znanego lekarstwa. Pozostaje w ciele, gdzie czasami pozostaje w stanie uśpienia, ale ma tendencję do okresowego przemieszczania się na powierzchnię skóry. Kiedy tak się dzieje, zwykle pojawiają się pęcherze, ale znikają po krótkim czasie. Chociaż osoba z opryszczką nie zawsze ma objawy, obecność wirusa w organizmie może powodować zmiany komórkowe, które można wykryć za pomocą wymazu cytologicznego.
Istnieją inne rodzaje infekcji, które również mogą prowadzić do nieprawidłowego wymazu cytologicznego. Na przykład infekcja drożdżakowa nie jest chorobą przenoszoną drogą płciową. Kobiety mogą cierpieć na takie infekcje, nawet jeśli nigdy nie uprawiały seksu. Dzieje się tak również w przypadku innych infekcji bakteryjnych. Mogą one jednak wpłynąć na wyniki egzaminu.
W niektórych przypadkach problem nie jest wynikiem stanu. Normalne nawyki mogą być przyczyną nieprawidłowego wymazu cytologicznego. Dobrym przykładem jest stosunek seksualny. Kobietom często zaleca się powstrzymanie się od seksu przed wykonaniem wymazu, ponieważ może to mieć wpływ na wyniki. Innym powszechnym nawykiem, który może wpływać na wyniki, jest używanie tamponów.