Istnieje wiele różnych rodzajów zapiekanek z makaronem, takich jak mięsna zapiekanka z makaronem z różnymi rodzajami mięsa i włoska zapiekanka z makaronem z makaronem rotini i sosem pomidorowym. Inne dania z makaronu mogą zawierać składniki inspirowane kuchnią meksykańską i hiszpańską zmieszane z różnymi odmianami makaronu, z których można łatwo zrobić zapiekankę makaronową bezglutenową lub wegetariańską. Najczęściej do zapiekanki z makaronem jako podstawowym składnikiem będzie używany rodzaj sosu do nadzienia, taki jak pokrojone w kostkę pomidory lub kremowa zupa zagęszczona. Do każdej zapiekanki możliwe są różne odmiany makaronu, w tym makaron rotini, spaghetti, anielskie włosy i makaron fettucini.
Mięsna zapiekanka z makaronem jest popularna wśród włoskich przepisów i często zawiera makaron rotini lub penne zamiast spaghetti lub anielskich włosów, które mogą stać się papkowate podczas pieczenia. Większość mięsnych zapiekanek z makaronem wykorzystuje mieszankę różnych mielonych lub całych mięs, takich jak kiełbasa wieprzowa, wołowina i mielony kurczak. Podstawowy sos, który często miesza się z zapiekanką, obejmuje pokrojone w kostkę, siekane lub puree pomidory oraz zioła, takie jak oregano i bazylia. Rozdrobniony ser cheddar lub colby jest również mieszany i posypywany na wierzchu przed pieczeniem, aby dodać smaku.
Meksykańska zapiekanka z makaronem zawiera składniki często używane w tradycyjnych przepisach na enchilada, takie jak sos enchilada, jalapeno, awokado i ser. Makaron najczęściej używany do zapiekanek meksykańskich to rotini, ale niektóre przepisy mogą wykorzystywać mieszankę rotini, fettucini lub spaghetti. Wraz z serem, który topi się podczas pieczenia i tworzy mięsistą konsystencję, często używa się mielonej wołowiny lub rozdrobnionego kurczaka, aby uzyskać masę i dodać smaku. Pokrojone w kostkę pomidory są powszechnie używane jako sos mieszany z makaronem i innymi składnikami, a kwaśną śmietanę można dodać, aby uzyskać bardziej kremowy, bogatszy smak i konsystencję.
Zapiekanka do pizzy z makaronem to świetny sposób na delektowanie się smakiem pizzy bez użycia skórki i często zawiera typowe składniki pizzy, takie jak sos pomidorowy, ser i pepperoni. Makaron rotini jest podstawą zapiekanki do pizzy, tworząc pod nią twardą warstwę, a zapiekanka jest pieczona, aby roztopić ser i podgrzać danie. W przypadku każdej zapiekanki z makaronem wiele produktów mięsnych można zastąpić lub wyeliminować, aby stworzyć wegetariańską zapiekankę. Dla osób wrażliwych na gluten obecny w makaronach pszennych, makarony używane w zapiekankach można zastąpić odmianami bezglutenowymi.