Zalety etanolu z trzciny cukrowej są bardzo widoczne, zwłaszcza w porównaniu z etanolem z kukurydzy. Trzcina cukrowa jest w stanie wyprodukować o wiele więcej energii niż kukurydza, po części dlatego, że łatwiej jest wyprodukować etanol z trzciny cukrowej. Kukurydza wymaga dodatkowych enzymów, co wiąże się z dodatkowymi etapami i kosztami procesu. Trzcina cukrowa oferuje również inne korzyści.
Podczas gdy kukurydza jest często uprawiana w różnych warunkach, co utrudnia określenie, ile będzie dostępne z roku na rok, zwłaszcza w przypadku pojedynczych roślin wytwarzających etanol na bazie kukurydzy, etanol z trzciny cukrowej jest znacznie bardziej przewidywalny. Uprawa cukru w tej części świata, w której jest przetwarzana na etanol, pozostaje stosunkowo stabilna z roku na rok, w przeciwieństwie do upraw w pasie kukurydzianym w Stanach Zjednoczonych. Podczas gdy region Środkowego Zachodu Stanów Zjednoczonych oferuje jedne z najbardziej żyznych gleb na świecie, wiele innych czynników może wpływać na uprawę kukurydzy. Szkodniki, susze, powodzie, a nawet silne wiatry mogą siać spustoszenie w kukurydzy. Chociaż to samo można powiedzieć o trzcinie cukrowej, wydaje się, że nieco lepiej znosi burzę.
Kolejną zaletą etanolu z trzciny cukrowej jest cykl zbiorów. Kukurydza sadzi się co roku, zwykle wiosną, a następnie zbiera się jesienią. Na cykl sadzenia przypada tylko jeden zbiór. Jednak trzcina cukrowa zapewnia w niektórych przypadkach nawet siedem zbiorów przed ponownym zasadzeniem. W ten sposób produkcja etanolu z trzciny cukrowej może być znacznie bardziej energetyczna i opłacalna.
Te czynniki mogą mieć duże znaczenie z wielu powodów. Trzcina cukrowa jest w stanie dotrzeć do zakładów przetwórczych w sposób bardziej konsekwentny i przewidywalny. Wytwórnia etanolu z trzciny cukrowej ma bardzo mało powodów do obaw, że producent nie będzie w stanie wywiązać się ze swoich zobowiązań umownych. Chociaż może to być również prawdą w przypadku kukurydzy przez większość czasu, będą lata, kiedy to również nie będzie prawdą.
Bilans energetyczny, czyli ilość włożonej energii w porównaniu z energią wyjściową, jest również znacznie wyższy w przypadku etanolu z trzciny cukrowej w porównaniu z etanolem z kukurydzy. Na każdą jednostkę energii włożoną w produkcję etanolu z kukurydzy powstaje 1.3 jednostki. Na każdą jednostkę energii zużytą do produkcji etanolu z trzciny cukrowej powstaje osiem jednostek. Daje to kolejną przewagę konkurencyjną cukru.
Należy zauważyć, że jeśli chodzi o dodatki do benzyny, produkty etanolowe, czy to z cukru, czy z kukurydzy, są bardzo podobne, biorąc pod uwagę sposób, w jaki reagują w silnikach samochodowych. Zanim dotrze do samochodu, został dopracowany do punktu, w którym jego pochodzenie nie ma znaczenia. Jedyną istotną częścią są koszty i korzyści energetyczne wynikające z jego produkcji. Bez względu na to, czy jest to kukurydza, czy trzcina cukrowa, etanol zapewnia czystszą benzynę o wyższej liczbie oktanów. Podobnie jak biodiesel, jest również odnawialnym źródłem paliwa.