Η χρηματοδότηση για μη κερδοσκοπικούς οργανισμούς μπορεί να προέλθει από πολλά μέρη. Οι επιχορηγήσεις και οι συμβάσεις παρέχουν συχνά ένα μεγάλο μέρος των κεφαλαίων ενός οργανισμού. Οι αμοιβές πελατών και οι εμπορικές επιχειρήσεις επιτρέπουν στους οργανισμούς να κερδίζουν χρηματοδότηση και για προγράμματα.
Οι επιχορηγήσεις του ιδρύματος και της κυβέρνησης παρέχουν συχνά σημαντικό μέρος της χρηματοδότησης για μη κερδοσκοπικούς οργανισμούς. Οι φορείς συχνά προετοιμάζουν προτάσεις επιχορήγησης όταν εφαρμόζουν ένα νέο πρόγραμμα για να ζητήσουν οικονομική βοήθεια από την κυβέρνηση ή ένα ίδρυμα. Εάν χορηγηθεί επιχορήγηση, ο οργανισμός θα λάβει ένα χρηματικό ποσό που θα δαπανηθεί για συγκεκριμένους σκοπούς βάσει της πρότασης και καθορίζεται από την πηγή χρηματοδότησης. Οι ανανεώσεις των επιχορηγήσεων ενδέχεται να είναι διαθέσιμες όταν δαπανηθούν τα αρχικά κεφάλαια.
Οι συμβάσεις, ειδικά οι κρατικές συμβάσεις, αποτελούν κοινή πηγή χρηματοδότησης για μη κερδοσκοπικούς οργανισμούς. Εάν μια μη κερδοσκοπική εταιρεία παρέχει μια υπηρεσία που θα μπορούσε να είναι χρήσιμη σε άλλους οργανισμούς, όπως η μεταφορά για άτομα με ειδικές ανάγκες, η υπηρεσία μπορεί να λάβει σύμβαση από την κυβέρνηση ή άλλον οργανισμό για την παροχή της υπηρεσίας. Μια σύμβαση ορίζει γενικά μια χρονική διάρκεια και τη διαδικασία πληρωμής. Οι δημοφιλείς τύποι συμβάσεων περιλαμβάνουν αποζημίωση κόστους, επιδόσεις και συμβάσεις διαχειριζόμενης φροντίδας και ο τύπος που χρησιμοποιείται καθορίζει τον υπολογισμό των πληρωμών.
Σε αντίθεση με τη δημοφιλή πεποίθηση, ένας μη κερδοσκοπικός οργανισμός μπορεί να έχει κέρδος εφόσον ξοδεύει τα κεφάλαια παρέχοντας υπηρεσίες στους πελάτες του. Η χρέωση των τελών πελατών για τις παρεχόμενες υπηρεσίες μπορεί να είναι μια σημαντική πηγή χρηματοδότησης για έναν μη κερδοσκοπικό οργανισμό. Δεν είναι ασυνήθιστο οι αμοιβές πελατών να καλύπτουν μερικές ή πλήρεις δαπάνες για ένα πρόγραμμα. Σε ορισμένες περιπτώσεις, τα τέλη που συλλέγονται από ένα δημοφιλές πρόγραμμα θα μπορούσαν να παρέχουν αρκετά κεφάλαια για την κάλυψη των εξόδων άλλων προγραμμάτων που εκτελούνται από τον οργανισμό επίσης.
Εκτός από τις αμοιβές πελατών, οι εμπορικές επιχειρήσεις παρέχουν μερικές φορές χρηματοδότηση για μη κερδοσκοπικούς οργανισμούς. Ορισμένες φιλανθρωπικές οργανώσεις πωλούν αγαθά για να κερδίσουν χρήματα για τα προγράμματά τους. Για παράδειγμα, μια κοινότητα συνταξιούχων μπορεί να πουλά χειροτεχνίες που δημιουργούνται από κατοίκους. Για να αποφευχθεί η απώλεια της φορολογικής απαλλαγής, μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα, το εμπορικό εγχείρημα πρέπει να σχετίζεται άμεσα με την αποστολή του οργανισμού και η επιχείρηση δεν μπορεί να γίνει πολύ μεγάλη. Οι προσόψεις ηλεκτρονικών καταστημάτων είναι δημοφιλείς καταστήματα για εμπορικές επιχειρήσεις μη κερδοσκοπικών οργανισμών, επειδή κοστίζουν λίγο για την εφαρμογή ή τη συντήρηση.
Τα φιλανθρωπικά καταπιστεύματα υπενθύμισης και τα προγράμματα κληροδοτημάτων παρέχουν επίσης μακροπρόθεσμη χρηματοδότηση για μη κερδοσκοπικούς οργανισμούς. Σε φιλανθρωπικά καταπιστεύματα υπενθύμισης, οι δωρητές παρέχουν μετοχές, ομόλογα ή μετρητά σε έναν οργανισμό, λαμβάνοντας φορολογική απαλλαγή και εγγυημένο εισόδημα εφ’ όρου ζωής. Μετά τον θάνατο του δότη, ο οργανισμός λαμβάνει το υπόλοιπο του καταπιστεύματος. Ομοίως, τα προγράμματα κληροδοτημάτων επιτρέπουν στους ανθρώπους να αφήνουν ένα μέρος των περιουσιακών τους στοιχείων σε έναν οργανισμό. Οι δωρητές ουσιαστικά περιλαμβάνουν τον οργανισμό στις διαθήκες τους και ο οργανισμός λαμβάνει τη δωρεά όταν ο δωρητής πεθάνει.