Τα ιαπωνικά επιδόρπια μπορεί να είναι παραδοσιακές υποθέσεις χρησιμοποιώντας τοπικά φρούτα, φυτά και ξηρούς καρπούς, ξένες εισαγωγές ή έναν μοναδικό συνδυασμό των δύο. Υπάρχουν πολλές τοπικές παραλλαγές ιαπωνικών επιδορπίων που είναι γνωστά ως meibutsu και επίσης εκδόσεις αναμνηστικών (omiyage) για τους τουρίστες. Τα παραδοσιακά ιαπωνικά επιδόρπια χρησιμοποιούν συστατικά όπως γλυκά φασόλια αζούκι, φρούτα, ξηρούς καρπούς και μότσι.
Το Mochi είναι ένα κολλώδες, κολλώδες κέικ ρυζιού που αποτελεί κεντρικό στοιχείο των ιαπωνικών γλυκών. Σερβίρεται συχνά τυλιγμένο γύρω από γλυκά όπως πάστα αζούκι (daifuku), anko και πάστα φράουλας. Ορισμένα επιδόρπια αρωματίζουν το mochi με γεύσεις όπως άνθη κερασιάς (σακούρα), ροδάκινο και πράσινο τσάι. Τα Mochi είναι πιο δημοφιλή την Πρωτοχρονιά.
Το Wagashi είναι ένα είδος επιδορπίου με βάση το μότσι. Δεν υπάρχει ένα είδος wagashi, αλλά αντίθετα υπάρχουν δεκάδες παραλλαγές. Παρασκευάζονται με φρούτα, ξηρούς καρπούς, αζούκι και μότσι. Το πράσινο τσάι συχνά σερβίρεται ως συμπλήρωμα στα γλυκά επιδόρπια.
Το Mochi χρησιμοποιείται επίσης για την παρασκευή ιαπωνικών γλυκών που ονομάζονται dango. Το Dango είναι μπάλες mochi που τοποθετούνται σε ένα σουβλάκι και βυθίζονται σε ένα άρωμα. Το παραδοσιακό φεστιβάλ dango βυθίζεται σε ένα σιρόπι σάλτσας σόγιας που ονομάζεται shouyu και ονομάζεται mitarashi dango. Ένα άλλο είδος dango είναι το bocchan dango που έχει μια κανονική μπάλα dango, μια μπάλα με γεύση πράσινο τσάι και μια μπάλα με γεύση αζούκι.
Το mochi μπορεί να κατασκευαστεί με διαφορετικό τρόπο για να παραχθεί μια σειρά από ζελέ. Υπάρχουν και άλλα ζελέ που ονομάζονται ζελέ άγαρ που χρησιμοποιούνται σε επιδόρπια όπως το anmitsu και το mitsumame. Αυτοί οι κύβοι ζελέ συνδυάζονται με συστατικά όπως αζούκι ή άνκο, φέτες φρούτων και σιρόπι mitsu.
Πολλά ιαπωνικά επιδόρπια είναι μια ανατροπή στις ξένες εισαγωγές. Για παράδειγμα, η καστέλλα είναι ένα κέικ που πήρε το όνομά του από την περιοχή της Καστίλλης της Ισπανίας, αλλά στην πραγματικότητα είναι η ιαπωνική εκδοχή του πορτογαλικού κέικ που είναι γνωστό ως Pao-de-lo. Το Castella είναι ένα παντεσπάνι που συχνά τρώγεται μόνο του ή συμπληρώνεται με καστανή ζάχαρη, πράσινο τσάι σε σκόνη ή αρωματισμένη ζάχαρη άχνη/πάγωμα.
Το παγωτό είναι ένα δημοφιλές επιδόρπιο και στην Ιαπωνία. Μια κούκλα βανίλια και μια άλλη παγωτό πράσινο τσάι σερβίρεται συχνά μαζί με φασόλια αζούκι και μότσι. Υπάρχει επίσης μια σειρά από παγωτά τυλιγμένα με μότσι που διατίθενται είτε με απλό περιτύλιγμα μότσι γύρω από βανίλια, παγωτό σοκολάτας ή πράσινο τσάι, είτε με αρωματισμένο μότσι γύρω από ένα απλό παγωτό.
Πολλά ιαπωνικά ξένα επιδόρπια έχουν περάσει από τη διαδικασία του πράσινου τσαγιού. Αυτό σημαίνει αντικατάσταση ενός συστατικού με πράσινο τσάι. Για παράδειγμα, υπάρχουν πολλές σειρές από μπάρες σοκολάτας με γεύση πράσινου τσαγιού. Υπάρχουν επίσης κέικ με πράσινο τσάι castella και άλλα σφουγγάρια, παγωτό πράσινο τσάι, cheesecakes και τιραμισού. Παρόμοιες εκδοχές έχουν επίσης γίνει με άρωμα άνθη κερασιάς.
Η Ιαπωνία έχει επίσης μια σειρά από γλυκά ψωμιά που μπορούν να σερβιριστούν ως επιδόρπιο. Το Melonpan μοιάζει με πεπόνι, αλλά είναι φτιαγμένο από κανονική ζύμη ψωμιού τυλιγμένη σε ζύμη μπισκότων πριν το ψήσιμο. Αυτά μπορούν να σερβιριστούν σκέτα, με κομματάκια σοκολάτας μέσα, γέμιση κρέμας ή αρωματισμένα με υλικά όπως σκόνη πράσινου τσαγιού και καραμέλα. Το Anpan είναι ένα γλυκό ψωμί με φασόλια αζούκι.