Υπάρχουν πολλοί διαφορετικοί τύποι θαλάσσιων ζώων στη λίστα των απειλούμενων ειδών για πολλούς διαφορετικούς λόγους. Συχνά, η ανθρώπινη επιρροή όπως τα ατυχήματα με βαρκάδα, η αλιεία, η ανάπτυξη των ακτών και η ρύπανση αποδίδουν υψηλό αριθμό θανάτων μεταξύ αυτών των θαλάσσιων ζώων. Περιστασιακά, τα αίτια της μείωσης του αριθμού είναι άγνωστα. Τα θαλάσσια θηλαστικά όπως οι σωστές φάλαινες, οι μανιάτες και οι ντουγκόνγκ έχουν μειωθεί σημαντικά σε αριθμό, μαζί με τις χελώνες, μερικά θαλάσσια πτηνά, καρχαρίες και σολομό.
Πολλοί θάνατοι θαλάσσιων ζώων προέρχονται από ανθρώπινη επιρροή. Ο ανθρώπινος κίνδυνος δεν τίθεται μόνο από το ψάρεμα, το κυνήγι και τη φαλαινοθηρία, αλλά και από ατυχήματα με σκάφη. Αυτό είναι ιδιαίτερα κοινό στα ρηχά κολυμβητικά ζώα που αναπνέουν αέρα, όπως διάφοροι τύποι θαλάσσιων θηλαστικών και χελωνών. Η ρύπανση μπορεί επίσης να προστεθεί στον κατάλογο των απειλούμενων θαλάσσιων ζώων.
Πολλοί τύποι θαλάσσιων χελωνών κινδυνεύουν. Αυτό το φαινόμενο συχνά προκύπτει από τον κίνδυνο που απειλεί τα αυγά των ζώων. Τα αυγά της χελώνας γεννιούνται στη στεριά, η οποία συχνά καταστρέφεται από την αστική ανάπτυξη κοντά στις ακτές. Τα παράκτια θέρετρα και οι τουριστικές περιοχές τείνουν να αποτελούν απειλή για πολλούς τύπους θαλάσσιων ζώων.
Οι φάλαινες είναι από τα πιο διαβόητα απειλούμενα θαλάσσια ζώα. Οι δεξιές φάλαινες και οι φάλαινες με τόξο κυρίως έχουν δει δραματική μείωση στον αριθμό και έχουν αντιμετωπίσει κρίσιμη απειλή. Ο αριθμός των δεξιών φαλαινών του Βόρειου Ατλαντικού έχει μειωθεί δραματικά για άγνωστους λόγους, αλλά υπάρχει υποψία ότι η φαλαινοθηρία δεν προκάλεσε αυτό μόνο. Αυτό μπορεί να είναι αποτέλεσμα συγκρούσεων σκαφών, ρύπανσης ή αναπαραγωγικών προβλημάτων μεταξύ των ζώων.
Οι λόγοι για τη μείωση του αριθμού των μανάτων και των ντούγκονγκ πιστεύεται ότι οφείλονται σε μεγάλο αριθμό θανατηφόρων συγκρούσεων σκαφών. Λόγω του γκριζωπού χρωματισμού αυτών των ζώων, οι άνθρωποι με βάρκες δυσκολεύονται να τα δουν. Επιπλέον, οι μανάτες και τα ντούγκον κινούνται πολύ αργά και μπορεί να δυσκολεύονται να ξεφύγουν από ένα ταχύπλοο σκάφος. Ένας μεγάλος αριθμός προγεννητικών θανάτων έχει αναφερθεί μεταξύ αυτών των ζώων, για λόγους άγνωστους στους βιολόγους.
Διάφοροι τύποι θαλάσσιων πτηνών έχουν απειληθεί, συμπεριλαμβανομένου του καφέ πελεκάνου. Αυτό το πουλί, που κάποτε συναντιόταν συνήθως στη Βόρεια, Κεντρική και Νότια Αμερική, αντιμετώπισε μεγάλο αριθμό θανάτων λόγω θρυμματισμού των αυγών κατά την επώαση. Τα κελύφη των αυγών αυτών των πουλιών πιστεύεται ότι έχουν γίνει επικίνδυνα λεπτά λόγω της χρήσης διχλωροδιφαινυλοτριχλωροαιθανίου (DDT). Από τα τέλη του 20ού αιώνα, πολλές μορφές DDT έχουν απαγορευτεί στις Ηνωμένες Πολιτείες.
Οι πιγκουίνοι μπήκαν επίσης στη λίστα των ζώων με εξαφάνιση. Ως αποτέλεσμα της υπεραλίευσης, οι προμήθειες τροφίμων για τον πιγκουίνο Humboldt, που βρέθηκαν στη Χιλή και το Περού, έχουν μειωθεί πολύ. Πολλοί θάνατοι μεταξύ αυτών των πιγκουίνων αποδόθηκαν επίσης σε εμπλοκές στα δίχτυα αλιείας.
Ο σολομός, ενώ συχνά θεωρείται ψάρια γλυκού νερού, θεωρείται επίσης μέρος του καταλόγου των απειλούμενων θαλάσσιων ζώων. Αυτά τα ψάρια αναπαράγονται σε γλυκό νερό, αλλά κολυμπούν μέχρι εκεί που τα ποτάμια και τα ρέματα συναντούν τη θάλασσα. Η μείωση της ποιότητας του νερού ως αποτέλεσμα της ρύπανσης έχει μειώσει τον αριθμό του σολομού. Οι εγκαταστάσεις διαχείρισης νερού, όπως φράγματα, έχουν επίσης επηρεάσει αρνητικά την ωοτοκία του σολομού.